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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】怎样判断其是构型稳定的？急求
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六块石头

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎样判断其是构型稳定的？急求 已有6人参与

各位大虾好，本人做的是酶反应机理，在PDB里面取出晶体结构，然后优化初始结构，我想知道我怎么知道得到的优化好的结构就是我需要的呢？有什么判断标准吗？
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1楼 2010-09-24 16:22:17
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你用的什么软件
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2楼2010-09-24 19:01:07
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
yjcmwgk(金币+1): 2010-09-24 22:23:04
引用回帖:
Originally posted by 六块石头 at 2010-09-24 16:22:17:
各位大虾好，本人做的是酶反应机理，在PDB里面取出晶体结构，然后优化初始结构，我想知道我怎么知道得到的优化好的结构就是我需要的呢？有什么判断标准吗？

优化结构与实验值相比较 相差不大就可以
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惺惺相惜情不自禁
3楼2010-09-24 21:42:51
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shalene

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+2):感谢交流 2010-09-25 16:13:11
算频率啊
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4楼2010-09-24 22:25:13
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lingznpmg

铁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小红豆(金币+3):感谢交流 2010-09-25 16:13:28
周期性模型的话，与实验值或前人的计算比较键长键角、磁距、能带等性质就可以。
团簇主要有键长键角、光谱项、能带等性质。

大家帮忙啊！
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5楼2010-09-24 22:57:05
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六块石头

银虫 (小有名气)
★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-25 16:13:47
我用的QM方法来模拟计算蛋白质机理，所以是用高斯来优化的
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6楼2010-09-25 10:23:45
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六块石头

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-09-24 21:42:51:

优化结构与实验值相比较 相差不大就可以

与什么相比较呢？能具体说一下吗？谢谢了
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7楼2010-09-25 10:24:46
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六块石头

银虫 (小有名气)
内容已删除
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8楼2010-09-25 10:25:20
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六块石头

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lingznpmg at 2010-09-24 22:57:05:
周期性模型的话，与实验值或前人的计算比较键长键角、磁距、能带等性质就可以。
团簇主要有键长键角、光谱项、能带等性质。

大家帮忙啊！

在实验性文章里边好像没有具体提到结构里的键长或者键角之类的，这怎么办呢？
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9楼2010-09-25 10:26:38
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六块石头

银虫 (小有名气)
★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-26 09:34:03
内容已删除
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10楼2010-09-25 10:27:11
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