24小时热门版块排行榜    

查看: 1421  |  回复: 11

六块石头

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】怎样判断其是构型稳定的?急求 已有6人参与

各位大虾好,本人做的是酶反应机理,在PDB里面取出晶体结构,然后优化初始结构,我想知道我怎么知道得到的优化好的结构就是我需要的呢?有什么判断标准吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你用的什么软件
2楼2010-09-24 19:01:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人


yjcmwgk(金币+1): 2010-09-24 22:23:04
引用回帖:
Originally posted by 六块石头 at 2010-09-24 16:22:17:
各位大虾好,本人做的是酶反应机理,在PDB里面取出晶体结构,然后优化初始结构,我想知道我怎么知道得到的优化好的结构就是我需要的呢?有什么判断标准吗?

优化结构与实验值相比较 相差不大就可以
惺惺相惜情不自禁
3楼2010-09-24 21:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shalene

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
小红豆(金币+2):感谢交流 2010-09-25 16:13:11
算频率啊
4楼2010-09-24 22:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingznpmg

铁虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
小红豆(金币+3):感谢交流 2010-09-25 16:13:28
周期性模型的话,与实验值或前人的计算比较键长键角、磁距、能带等性质就可以。
团簇主要有键长键角、光谱项、能带等性质。

大家帮忙啊!
5楼2010-09-24 22:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六块石头

银虫 (小有名气)

★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-25 16:13:47
我用的QM方法来模拟计算蛋白质机理,所以是用高斯来优化的
6楼2010-09-25 10:23:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六块石头

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-09-24 21:42:51:

优化结构与实验值相比较 相差不大就可以

与什么相比较呢?能具体说一下吗?谢谢了
7楼2010-09-25 10:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六块石头

银虫 (小有名气)

内容已删除
8楼2010-09-25 10:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六块石头

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lingznpmg at 2010-09-24 22:57:05:
周期性模型的话,与实验值或前人的计算比较键长键角、磁距、能带等性质就可以。
团簇主要有键长键角、光谱项、能带等性质。

大家帮忙啊!

在实验性文章里边好像没有具体提到结构里的键长或者键角之类的,这怎么办呢?
9楼2010-09-25 10:26:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六块石头

银虫 (小有名气)

★ ★
小红豆(金币+2):感谢分享 2010-09-26 09:34:03
内容已删除
10楼2010-09-25 10:27:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 六块石头 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 295求调剂 +8 19171856320 2026-02-28 8/400 2026-03-02 11:19 by yuchj
[考研] 268求调剂 +3 简单点0 2026-03-02 4/200 2026-03-02 11:14 by 黑!在干嘛
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +8 YXCT 2026-03-01 9/450 2026-03-02 11:01 by 无际的草原
[考研] 0854复试调剂 276 +4 wmm9 2026-03-01 6/300 2026-03-02 09:28 by 热情沙漠
[考研] 材料学调剂 +10 提神豆沙包 2026-02-28 12/600 2026-03-02 09:26 by 李老师!
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[基金申请] 本子写完了,给DS兄弟看了,得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[基金申请] 成果系统访问量大,请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦,已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[考研] 275求调剂 +3 明远求学 2026-03-01 3/150 2026-03-01 22:29 by 刘兵
[考研] 0856化工专硕求调剂 +12 董boxing 2026-03-01 12/600 2026-03-01 19:45 by 材子momo
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
请填处理意见