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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

[求助] PCR , 双酶切,连接问题

请问一下PCR用高保真的酶P 3000多的片段,突变率大吗?还有PCR 的目的片段纯化后,双酶切效果如何?把两个目的片段同时往载体上连的话,一个片段是3000bp,一个是2000bp,载体5380bp,用的是TAKARA的连接试剂盒,两个片段的合适比例是多少啊?
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生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
12楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-28 15:21:04:
楼主要的是连接正确的载体,在下以为楼主可以先将目的片段PCR,连接到测序载体上,获得正确的目的片段,大量摇菌提质粒,酶切回收,可能会含有载体的污染,但相信大部分应该是目的片段吧,然后将载体和两个片段用 ...

我就是这样子做的,但是菌落pcr只是验证你的目的片段的吧。这个是没问题的。就是两个不同的质粒酶切连接,谨小慎微的还是会出现载体污染,就算酶切时你保证没有杂带污染,但出来的结果。。。。。
生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
15楼2011-08-29 14:22:17
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

青菜小虫(金币+5): 谢谢你的解答。 2011-08-27 14:26:48
1949stone(MolEPI+1): 这个要epi 13k的 可以么? 2011-08-27 21:22:53
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star,有记录的是7.3k。没错碱基,楼主可以试一下!目的片段纯化后如果量足够大,酶切也没问题的,别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些,但也能成功,曾经连接过14k,1k,700bp的和7.3k,3.8k,700bp的能连上但费了不少功夫!关于比例这个楼主最好咨询一下技术顾问,偶也没太多的经验,就是多做了些连接转化就搞定了!
jiayoubashaonian
2楼2011-08-27 12:08:07
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-27 12:08:07:
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star,有记录的是7.3k。没错碱基,楼主可以试一下!目的片段纯化后如果量足够大,酶切也没问题的,别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些,但也能 ...

你说的Takara的primer star,我在Takara的目录上没有找到,能给我具体指一下名称吗?还有目的片段纯化后酶切为什么要加保护碱基?再麻烦你一下啦
生命即这般无尽变数,辗转来去皆苛求不得
3楼2011-08-27 14:53:25
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青菜小虫

银虫 (著名写手)

风居住的街道

引用回帖:
2楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-27 12:08:07:
我们实验室扩增长片段常用的是Takara的primer star,有记录的是7.3k。没错碱基,楼主可以试一下!目的片段纯化后如果量足够大,酶切也没问题的,别忘了加上保护碱基。两个大片段往载体上连接难度可能大些,但也能 ...

如果酶切位点不是很靠边的话,是不是保护碱基也可以不用加?
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4楼2011-08-27 14:57:28
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