| 查看: 2173 | 回复: 16 | ||
adslye银虫 (正式写手)
|
[求助]
文章被人抢先发了！想用信息学分析改变文章方向。问：信息学分析相关。
|
 背景：辛苦做的东西，被洋人先发了！！！！！！！悲剧~~~~~~~~ 有一部分数据是一定数量的基因表达量real-time pcr数据和LC-MS数据。测了一个代谢通路中大部分基因，大约20个基因在两种条件，9个连续时间点的表达量（20*2*9=360个数据），以及在这些时间点每个基因对应作用的化合物的含量(360）。这是一个有价值的代谢通路，但很多基因功能研究不深。 本人药学出生，研究生转生物，对于生物信息学，实在是杀不动了 目的：能否通过生物信息学手段从这些数据中挖出点东西，做一篇实验与信息学结合的文章。 想问： 1.这种样本量做聚类分析有意义吗？想把一些各时间点表达趋势相似的基因和化合物聚类。这样可能说明它们受同一些因素调控。 2.同样关联分析可做吗？因为很多基因的功能没被研究，但有几个潜在的转录因子被报道。可以根据转录因子和可能目的基因的表达趋势做关联分析吗？（就是说很可能这个转录因子调控这些基因） 3.如果1或2可行，有哪些软件可以做。 4.有没有其他的信息学手段分析下以上那些数据？因为很可能我病急乱投医想的点子其 实不可行。 5.这样的文章应该发什么样的杂志，因为结合了生物，化学，信息学，但都不深入。有过来人吗？ 自己已有思路（重复的想法就不用回复了，多谢）： 1.通过化合物的含量以及基因的表达量，基本可以确定哪些地方是调控的节点。 2.两种诱导条件诱导机制上的差异与关系。调控哪些基因和化合物这个也可以知道。 这次有力的回答的奖励都>10!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!奖池不时补充！！！！！ 感谢各位了！！！！！！！！！！！！！！！！！！！！ [ Last edited by adslye on 2011-8-27 at 15:27 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 计算机方向研究形式化方法是不是比较难出sci文章啊？
已经有29人回复
- 分析化学中的动力学研究内容是哪些？审稿人要求用理论来提高文章档次，如何回答呀?
已经有9人回复
- 自己改进了一个模型，从不同角度分析数据，写了两篇文章，是否算雷同
已经有15人回复
- 【分享】袁隆平院士两优培九超级杂交水稻转录组分析文章，发表在PNAS上
已经有59人回复
- 【讨论】有做人脸识别，舌相医学诊断的吗，导师今天传给我一篇文章，说这个方向很新
已经有16人回复
- 【求助/交流】生物信息学的文章
已经有5人回复
- 【求助】中药分析文章投稿问题，求杂志社推荐
已经有22人回复
- 《光谱学与光谱分析》接收英文文章吗？
已经有4人回复
- 【分享】神经计算、机器学习最好会议之一的nips历年（1987-2008）文章免费下载
已经有50人回复
adslye
银虫 (正式写手)
- BioEPI: 10
- 应助: 6 (幼儿园)
- 贵宾: 0.244
- 金币: 364.9
- 散金: 766
- 红花: 6
- 帖子: 514
- 在线: 119.5小时
- 虫号: 845336
- 注册: 2009-09-11
- 性别: GG
- 专业: 流行病学方法与卫生统计
2楼2011-08-26 17:07:51
cexoihtydx
金虫 (正式写手)
- BioEPI: 12
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 581.3
- 散金: 906
- 红花: 5
- 帖子: 766
- 在线: 263.3小时
- 虫号: 722752
- 注册: 2009-03-14
- 性别: GG
- 专业: 人类遗传学
3楼2011-08-26 19:09:25
amisking
荣誉版主 (文坛精英)
- 应助: 45 (小学生)
- 贵宾: 28.304
- 金币: 51353.9
- 散金: 3080
- 红花: 78
- 沙发: 17
- 帖子: 13022
- 在线: 839小时
- 虫号: 514230
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
- 管辖: 分子生物
4楼2011-08-26 19:59:40
adslye
银虫 (正式写手)
- BioEPI: 10
- 应助: 6 (幼儿园)
- 贵宾: 0.244
- 金币: 364.9
- 散金: 766
- 红花: 6
- 帖子: 514
- 在线: 119.5小时
- 虫号: 845336
- 注册: 2009-09-11
- 性别: GG
- 专业: 流行病学方法与卫生统计
5楼2011-08-27 07:54:43
wanhscn
木虫 (职业作家)
哲学@草根
- 应助: 53 (初中生)
- 贵宾: 0.87
- 金币: 3895.7
- 散金: 877
- 红花: 27
- 沙发: 14
- 帖子: 3642
- 在线: 526.2小时
- 虫号: 1376762
- 注册: 2011-08-22
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
【答案】应助回帖
★ ★ ★
lstt09nk(金币+3): 感谢交流， 2011-08-27 10:36:33
adslye(金币+15): 感谢！思路我懂了。聚类用什么软件做呢？ 2011-08-27 12:21:17
adslye(金币+20): 后面那两贴不是应助，不能给金币。非常感谢！ 2011-08-27 15:25:14
lstt09nk(金币+3): 感谢交流， 2011-08-27 10:36:33
adslye(金币+15): 感谢！思路我懂了。聚类用什么软件做呢？ 2011-08-27 12:21:17
adslye(金币+20): 后面那两贴不是应助，不能给金币。非常感谢！ 2011-08-27 15:25:14
|
做关联分析要有群体以及相关群体结构数据（软件Tassel， Structure ），如果没有的话，那还不如做转基因研究功能。 聚类是要做，聚类可以对功能的分析提供参考，不过需要多个植物物种包括水稻拟南介的基因序列，这样根据水稻拟南芥的功能情况以及聚类的结果分析你的物种。 |
6楼2011-08-27 09:17:04
wanhscn
木虫 (职业作家)
哲学@草根
- 应助: 53 (初中生)
- 贵宾: 0.87
- 金币: 3895.7
- 散金: 877
- 红花: 27
- 沙发: 14
- 帖子: 3642
- 在线: 526.2小时
- 虫号: 1376762
- 注册: 2011-08-22
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
7楼2011-08-27 15:05:59
wanhscn
木虫 (职业作家)
哲学@草根
- 应助: 53 (初中生)
- 贵宾: 0.87
- 金币: 3895.7
- 散金: 877
- 红花: 27
- 沙发: 14
- 帖子: 3642
- 在线: 526.2小时
- 虫号: 1376762
- 注册: 2011-08-22
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
8楼2011-08-27 15:07:19
jsh0610
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 9642.9
- 红花: 4
- 帖子: 972
- 在线: 115.5小时
- 虫号: 290845
- 注册: 2006-10-28
- 性别: MM
- 专业: 生物力学
9楼2011-08-28 22:46:09
scelab
荣誉版主 (文坛精英)
小木虫之有关部门负责人
- 应助: 63 (初中生)
- 贵宾: 1.475
- 金币: 8294.6
- 散金: 4158
- 红花: 39
- 沙发: 99
- 帖子: 21277
- 在线: 3169.3小时
- 虫号: 482065
- 注册: 2007-12-20
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
10楼2011-08-28 22:54:59
