【答案】应助回帖

11楼2011-08-29 09:46:19

castorsunqq

12楼2011-08-29 09:55:36

jsh0610

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 9642.9
红花: 4
帖子: 972
在线: 115.5小时
虫号: 290845
注册: 2006-10-28
性别: MM
专业: 生物力学

【答案】应助回帖

adslye(金币+5): 不太合实际，因为没时间做转基因了。。。感谢帮忙~ 2011-08-30 10:34:33

转基因研究功能:结合你的药理应该有点意思

jjii

13楼2011-08-29 19:20:19

tigeryth

金虫 (小有名气)

BioEPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
金币: 758
红花: 1
帖子: 201
在线: 7小时
虫号: 240108
注册: 2006-04-07
专业: 细胞信号转导

【答案】应助回帖

adslye(金币+30): 很有用！ 2011-09-09 20:45:00

首先，可以肯定的是，整个研究思路是正确的---生物实验的结果驱动生物信息学分析，后者在反哺前者。

实验的结果，或者你考量的生物学特征直接影响要采用什么模型来分析，比如20个gene，2个condition,9个time point，每个gene的表达量，形成一个矩阵。这些都是你要量化入生物信息学模型中去的。基于你是药学出身，那一定对药代有些了解吧。这样滴话，如何把你的实验结果转化为特征向量应该比较容易一些。在此基础上再了解那些生物信息学方法（其实说白了，就是一些机器学习---machine learning）特点，需要什么样的输入，会产生什么样的输出，这应该不难！！如果在会点编程，比如c++，那更容易了！！

妄言一番！！！见笑！

14楼2011-09-09 00:02:00

adslye

银虫 (正式写手)

BioEPI: 10
应助: 6 (幼儿园)
贵宾: 0.244
金币: 364.9
散金: 766
红花: 6
帖子: 514
在线: 119.5小时
虫号: 845336
注册: 2009-09-11
性别: GG
专业: 流行病学方法与卫生统计

引用回帖:

14楼: Originally posted by tigeryth at 2011-09-09 00:02:00:
首先，可以肯定的是，整个研究思路是正确的---生物实验的结果驱动生物信息学分析，后者在反哺前者。

实验的结果，或者你考量的生物学特征直接影响要采用什么模型来分析，比如20个gene，2个condition,9个time p ...

哥么，关于使用的软件可否有推荐？
参考文献是否有推荐？
继续按你的思路，
再详细点，最好是一个简要执行计划。
剩下的金币都给你了。

非常感谢！！！

15楼2011-09-09 20:47:57

tigeryth

金虫 (小有名气)

BioEPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
金币: 758
红花: 1
帖子: 201
在线: 7小时
虫号: 240108
注册: 2006-04-07
专业: 细胞信号转导

【答案】应助回帖

adslye(金币+75): 给力！多谢！！！ 2011-09-10 10:57:59

现有的软件我没有用过。需要地话都是自己处理数据，自己编程。至于文献后面再说；

要是说道计划的话，换成我，我会这样做：实验做到这个程度，想用生物信息学的方法来分析，或挖掘一下现有的实验结果，那首先我要明白所谓的生物信息学方法本质上都是机器学习方面的东东。好，那就找一找呗。看看这个圈子里都是一些什么东东。我会发现什么ANN，svm，k-mean等等。这些东东找出来了。那就去ncbi等一些网站去搜呗。如svm+dna等等------这就提到了找什么样的文献了吧！肯定的是，这方面的文章确实有一定数量地！然后，回来根据这些文章熟悉路子。然后依葫芦画个瓢。最后，可能的话自己再创新一下，不管是生物学属性选择上，还是数据转化等等。

妄言一番！！见笑！！！
祝你成功！！

16楼2011-09-10 00:04:35

chibang1220

木虫 (著名写手)

应助: 42 (小学生)
金币: 5697.7
散金: 68
红花: 8
帖子: 1435
在线: 333.1小时
虫号: 1653055
注册: 2012-02-29
性别: GG
专业: 生物物理、生物化学与分子

我的被国人抢了555555

人的差别在于业余时间

17楼2012-04-22 20:47:43