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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

[交流] 为什么提取的DNA总是降解?已有27人参与

各位大侠,为什么我提取的DNA总是降解呢?用的是传统的苯酚-氯仿抽提的方法,最后一步加入冰乙醇沉淀的时候能看到大量的絮状沉淀,TE溶解过夜,琼脂糖胶检测时条带却是这样(如图)。分光光度计检测浓度和纯度都正常。实验室几个人提取都是这样,不知道是什么原因,所用的试剂已经重新配过,还是这个结果。请问有没有遇到过类似情况的,这是什么原因,怎么解决呢?请大家指点帮助~


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adslye

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by 永不后悔2838 at 2011-08-19 09:00:22:
不是用液氮研磨的,用的是动物组织,剪碎的。应该不是消化的问题,加冰乙醇沉淀时候出来大量的絮状沉淀,不过这时候可能DNA已经成小片段了。请帮我想想还有没有别的原因呢,谢谢您的建议!

大量絮状?看你凝胶条带不亮额。溶得很稀?
我做植物的,当我出现大量絮状都是因为多糖。gDNA一开始不会出现很多。动物我不知道会有哪些干扰物质。
另外,看silicare的提醒。我重看了你的胶。首先两块胶都不亮,尤其是下面的,marker都不亮。EB是不是加少了,还是胶放久了。
你marker是多少的。感觉你的条带都是隐约的两条。这样的话有可能是降解不完全的RNA。RNA18S大约1900,28s大约4700。你自己对照下。而这样有可能就是用错酚了。)
只能帮你分析这么多了。不过楼上有位建议不错:用新买试剂盒,能提出,说明现有试剂有问题(要不用错,要不过期)。不能提出,那就是样品在组织里已经降解。

[ Last edited by adslye on 2011-8-19 at 10:13 ]
21楼2011-08-19 09:21:37
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silicare

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
注意你酚氯仿的PH值
2楼2011-08-18 14:27:01
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 永不后悔2838 at 2011-08-18 14:25:07:
各位大侠,为什么我提取的DNA总是降解呢?用的是传统的苯酚-氯仿抽提的方法,最后一步加入冰乙醇沉淀的时候能看到大量的絮状沉淀,TE溶解过夜,琼脂糖胶检测时条带却是这样(如图)。分光光度计检测浓度和纯度都正 ...

非常感谢,那个都是从公司买的,而且也换过不同的,结果还一样,请问还有别的可能吗?
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3楼2011-08-18 17:38:06
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永不后悔2838

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by silicare at 2011-08-18 14:27:01:
注意你酚氯仿的PH值

非常感谢,那个都是从公司买的,而且也换过不同的,结果还一样,请问还有别的可能吗?
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4楼2011-08-18 17:39:01
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