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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 关于粗粒化，希望各位做这方面的进来讨论下
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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 关于粗粒化，希望各位做这方面的进来讨论下

1.看文献中大部分做粗粒化的都是应用于大分子链，那可以用在团簇中吗？例如将一个C60看做是一个珠子。如果可以的话珠子之间相互作用的势函数和参数如何得到？
2.粗粒化侯通常通过软件什么来实现动力学模拟呢？GROMACS可以吗？
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1楼 2011-08-13 17:03:15
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leimiao_hit

木虫之王 (文学泰斗)
★ ★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-08-15 09:24:27
ben_ladeng(金币+1): 可以具体再给点说明哈 2011-08-15 16:59:41
GROMACS可以。。。。。。。。。。。。。。。。。
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2楼2011-08-13 17:14:51
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shengxiang

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by leimiao_hit at 2011-08-13 17:14:51:
GROMACS可以。。。。。。。。。。。。。。。。。

那诸如采用什么势函数和参数我该如何得到呢？
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3楼2011-08-15 13:04:25
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