审稿人要求最好用实验验证模拟结果，怎么办？偶就会模拟，不会实验，如何答复？ - 分子模拟 - DS/Sybyl/Autodock

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416114799

至尊木虫 (知名作家)

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注册: 2010-04-14
专业: 环境微生物学

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+6, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-08-15 09:21:52

模拟实验其实并不难，举个例子，比如说你对某个实验（这里与你的思路刚好相反，我们一般是要做实验，但是想先通过模拟得出一些思路，再去验证），那我就用数学建模来判断到底处于什么情况下我的实验设计才是科学的（一般设计多因素时），当建模结果出来后，就按照这个结果去实际操作，即把建模的各个参数带到实验中去，看看结果到底是不是最优。
你模拟只是一个理论上的东西，虽然与数学建模不是一档子事，但是思路是一样的，建立了模型最好去验证它，这样才具有新意，发文章不都讲新意嘛，而我们平常通过数学建模是为了找到最优条件，免得浪费人力物力去做大量不必要的实验，通过这个方法也可以提高科学性，我觉得你还是去验证下吧。
假如说，你做了一个关于什么分子（具有吸附能力的）对废水中金属离子的吸附模型，要验证它是很简单的，可以设置时间、pH、温度、初始浓度等为参数，进行控制变量验证，得出你这个理论是否可行。我想，你的分子模型有点像吸附动力学和热力学中的等温吸附线，换句话说就是我们平常做实验时的标注曲线一个意思，通过这个曲线的r值（相关系数），与你实验结果对比，可以知道你的实验中吸附动力学和热力学是属于哪个模型，通过模型的分析就可以知道机理所在。所以你，分子模型只是一个桥梁，是沟通表观现象与机理的桥梁。
我们平常做实验往往要研究机理，这就是正向思维，即通过实验结果与模型的相关性去判断它的机理所在；而先建模，再去验证，则是逆向思维，其实二者都是为了解决科学工作中的实际问题而已。我认为模拟与模型是一个很接近的东西，模拟更接近实际情况而已。用模型去说明模拟的结果，具有一定的意义，但是通过实际验证会更好，毕竟模拟是为了“模拟”实际的东西，再用模型去说明，则会越说越糊涂。
希望对你有所帮助。

[ Last edited by 416114799 on 2011-8-13 at 14:34 ]