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friya0910

新虫 (正式写手)

[交流] 表达载体的构建 已有6人参与

本人已将目的片段载体亚克隆至克隆载体pMD19-T(Simple)载体中,现在要构建表达载体,用限制性内切酶将目的片段从克隆载体上切下,20微升的酶切体系中加10微升的质粒。遇到一个问题就是双酶切后克隆载体片段挺亮的,但目的片段非常的淡(目的片段较小,285bp),这样会不会影响后面的连接反应啊?我看网上说要保证连接的成功,目的片段和载体的浓度最好都大一些。如果做PCR然后酶切PCR产物的话,又存在扩增过程中可能出现突变或者是无法判断是否酶切完全。请各位高手指点一下啊!

图片信息说明,Mark:200、500、800、1200、2000、3000、4500
第一张图,除Mark外左数第一第二泳道分别为NcoI单酶切pET32a和BamHI单酶切pET32a,第三泳道为上述两酶双酶切pET32a,第四泳道为双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体;均是20微升体系,质粒10微升,酶各自1微升,切3h。

第二张图,第一第二泳道NcoI和BamHI分别单酶切pET32a,第三泳道Mark,第四泳道双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体(质粒为公司测序后返还的质粒),切4h,第五泳道为双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体后切胶回收的目的片段,切了3管,每管20微升的体系,10微升的质粒。

第三张图,除Mark外左数第一和第二泳道为双酶切双酶切带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体,第三泳道为未酶切的带有目的片段的pMD19-T(Simple)载体。切了4h。

大家帮我看看,pET32a载体3h和4h双酶切切开了没?目的片段的量做连接是不是太少了?有没有什么好的建议啊!






[ Last edited by friya0910 on 2011-8-11 at 09:22 ]
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imfly77

木虫 (小有名气)


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引用回帖:
15楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-11 10:43:04:
谢谢指导啊!我今天先切5管,然后切胶看一下,如果目的片段还是太淡的话我再考虑做PCR,可是我就怕用PCR的话酶切的时候不太好判断目的片段是否酶切完全啊,如果双酶切PCR产物的话一般都切多长时间的呀?

(1)酶切的话不用做5管那么麻烦,直接1管100ul就行够了,体系按比例扩大。
(2)双酶切反应速度看酶,我以前用NEB的酶一般是切2-12个小时左右,得看是不是着急了。据说NEB也有快速内切酶,切十几分钟就行,因为没用过所以不好说。
(3)PCR产物切干净与否不会太影响后续的克隆——因为只有切开的能连上去。
但载体的话就一定要尽可能切干净了。

这方面的实验细节尽可能问师兄们吧。
16楼2011-08-11 15:00:35
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xbl3688

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
我用的连接体系中,目的片段与载体的体积比是7:1,这样就好一些。你的载体是高表达载体吗?
生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
3楼2011-08-10 20:27:55
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen


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1949stone(MolEPI+1): 天使大哥 要epi好办啊 2011-08-10 20:51:51
1:楼主的目的片段285bp,确实太小了,20ul体系添加10ul重组载体,然后进行酶切,当然是可以酶切开的,但是你的目的片段由于太小了,所以导致出来的质量太小而很淡,这样做链接的话成功的概率确实很低;何不扩大你的酶切体系至50ul或者更多,然后多添加一些酶,多切一会,然后跑个电泳,做一个切胶纯化,然后再跑电泳定量一下,做一个连接,这样成功概率会大很多;
2:当然了,我还是建议你直接用原来基因的引物做一个PCR,然后纯化,酶切,再纯化,然后进行连接,这样也是很快的,而且成功率也比较高的!

祝好运!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
4楼2011-08-10 20:50:11
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 空谷幽风 at 2011-08-10 19:45:32:
目的片段的亮度是载体的1/N(N代表载体与目的片段的分子量之比),再加上你的片段比较小,所以你下次酶切的时候请多切些质粒。或者你把重组质粒的跑胶图片给我,我给你推荐个酶切体系。最好是切下来去连表达载体,原 ...

今天跑了个图,现在电脑关了,明天传上来啊!
5楼2011-08-10 21:13:54
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