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shuihaizi

金虫 (小有名气)


[交流] 做一个克隆所需的最短时间?比比谁更高效快速!

克隆一个基因:
第一天:小体系PCR(上午)-大体系回收(下午)-小样酶切-大体系酶切回收(包括载体)(晚上)-连接
第二天:早晨转化-晚上摇菌
第三天:PCR鉴定和提质粒酶切鉴定(上午提,下午鉴定
一切顺利的情况下,紧忙乎,有没有更快更更高效的体系啊?
求交流!
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西瓜(金币+3): 鼓励分享经验 2011-08-11 12:04:05
shuihaizi(金币+3): 2011-08-11 13:18:23
引用回帖:
11楼: Originally posted by shuihaizi at 2011-08-10 16:39:42:
你们用的是什么酶啊(PCR,连接酶)?用什么试剂盒回收啊?你说的菌落pcr能详细点吗?还是直接用1h的菌液就可以直接PCR了,体系是怎样的呢?

PCR 用pfu  或者PBO;连接酶用fermentas的T4连接酶,不过buffer我们公司自己配的,后来我试了一下他们公司带的buffer,也挺好用的;
菌落PCR就是先挑单菌落在200ml的培养基中摇菌1h,然后取2.5ul做PCR(30ul反应体系)
反应体系                    体积         
H2O                                     23 μl   
10 ×PCR缓冲液             3 μl  
正向引物 (50pmol/μl)           0.5 μl                           
反向引物 (50pmol/μl)           0.5μl      
DNTP (10mmol/L each)           0.3 μl         
菌液                       2.5 μl
Taq DNA聚合酶 (5U/μl)         0.2 μl                        
总体系                    30 μl
14楼2011-08-10 19:34:51
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cloverplm

金虫 (小有名气)



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shuihaizi(金币+1): 2011-08-10 16:33:51
哎,一般都是这个样子的啦,公司效率会高一点,因为有很多机器,很多Items可以同时做。
3楼2011-08-09 22:53:26
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wzqno

金虫 (小有名气)



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shuihaizi(金币+1): 2011-08-10 16:34:01
基本上最快也就这速度了,你可以用NEB的内切酶,一个小时搞定酶切,稍微快点
4楼2011-08-10 10:45:23
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dhd997(金币+3): good 2011-08-10 12:12:02
shuihaizi(金币+1): 2011-08-10 16:34:40
原先在公司做的时候时间是这么安排的:
第一天:小体系PCR(上午)-大体系回收(下午)-小样酶切-大体系酶切回收(包括载体)(晚上)-连接转化
第二天:早上摇菌,1小时候菌落PCR验证,大概中午能出菌检结果,下午可以酶切验证或测序
fermentas的普通T4连接酶,我22℃连半个小时足够了,所以晚上连接转化可以一起做。
6楼2011-08-10 11:37:07
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