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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质二级结构推测

根据基因序列能不能推测蛋白质二级结构和三级结构，在线测还是用软件，求告知。
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1楼 2011-08-05 15:48:42
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

happywoheni(金币+1): 2011-08-05 19:07:47
1949stone(MolEPI+1): 神的操作 2011-08-06 11:46:28
引用回帖:
1楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-05 15:48:42:
根据基因序列能不能推测蛋白质二级结构和三级结构，在线测还是用软件，求告知。

根据基因序列，利用DNAmzn等软件把基因序列翻译成蛋白序列，可以预测蛋白质二级结构和三级结构，以下是部分预测网站。

1)  蛋白质二级结构预测：
PSIpred：http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
GOR5：http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin ... page=npsa_gor4.html

2）蛋白质的三级结构预测：
同源模建法SWISS-MODEL：http://swissmodel.expasy.org/
Threading法3D-PSSM ：http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~3dpssm/
从头预测法HMMSTR/Rosetta：
http://www.bioinfo.rpi.edu/~bystrc/hmmstr/server.php

3）蛋白质的功能分析：
PROSITE：http://www.expasy.ch/prosite/
Smart：http://smart.embl-heidelberg.de/

相关的理论知识，可以进一步阅读：蛋白质的结构预测与分子设计（附件！）
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2楼2011-08-05 16:31:24
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zhoumin-09
顶
3楼2011-08-05 17:00:02
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