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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

happywoheni(金币+1): 2011-08-05 19:07:47
1949stone(MolEPI+1): 神的操作 2011-08-06 11:46:28
引用回帖:
1楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-05 15:48:42:
根据基因序列能不能推测蛋白质二级结构和三级结构,在线测还是用软件,求告知。

根据基因序列,利用DNAmzn等软件把基因序列翻译成蛋白序列,可以预测蛋白质二级结构和三级结构,以下是部分预测网站。

1)  蛋白质二级结构预测:
PSIpred:http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/
GOR5:http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin ... page=npsa_gor4.html

2)蛋白质的三级结构预测:
同源模建法SWISS-MODEL:http://swissmodel.expasy.org/
Threading法3D-PSSM :http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~3dpssm/
从头预测法HMMSTR/Rosetta:
http://www.bioinfo.rpi.edu/~bystrc/hmmstr/server.php

3)蛋白质的功能分析:
PROSITE:http://www.expasy.ch/prosite/
Smart:http://smart.embl-heidelberg.de/

相关的理论知识,可以进一步阅读:蛋白质的结构预测与分子设计(附件!)
2楼2011-08-05 16:31:24
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