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ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 对配合物结构的处理(不优化,取代基修饰,部分优化) 已有5人参与

在计算配合物的性质前,要对结构进行一些处理。首先通常是从晶体结构中取一个单元。
然后可能做出以下选择:
1.若单元较大,可能不优化而直接计算分子轨道等。
2.把一些较大取代基改成较小取代基(如甲基改为氢)后,完全优化。
3.固定一些键或原子,再部分优化。
不少文献中采用前两种方法,而第三种方法,起码在配合物;领域我还没见过。
那么,请问大家一般是怎么处理的。谢谢。
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ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
1141312楼: Originally posted by oyljw at 2011-08-11 09:25:49
全优化了  但是结果达不到审稿人要求 (要求键长键角相对误差在%1一下)正心急火燎中........................................

请问您的相对误差是怎么来的?是否把优化后的结构与晶体结构相比?
9楼2012-08-07 16:45:04
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
全优化了  但是结果达不到审稿人要求 (要求键长键角相对误差在%1一下)正心急火燎中........................................
独立之精神自由之思想
2楼2011-08-11 09:25:49
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angiu

银虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 2011-08-11 17:55:00
如果取代基太大或者对反应影响很小,譬如说做手性催化的立体中心,那开始做机理能量时先用小基组代替,有必要再还原完全的结构
3楼2011-08-11 16:59:49
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ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by angiu at 2011-08-11 16:59:49:
如果取代基太大或者对反应影响很小,譬如说做手性催化的立体中心,那开始做机理能量时先用小基组代替,有必要再还原完全的结构

是“小基组”还是“小基团”?
4楼2011-08-11 22:59:04
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