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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 对配合物结构的处理（不优化，取代基修饰，部分优化）
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ZJboy

木虫 (著名写手)

[交流] 对配合物结构的处理（不优化，取代基修饰，部分优化） 已有5人参与

在计算配合物的性质前，要对结构进行一些处理。首先通常是从晶体结构中取一个单元。
然后可能做出以下选择：
1.若单元较大，可能不优化而直接计算分子轨道等。
2.把一些较大取代基改成较小取代基（如甲基改为氢）后，完全优化。
3.固定一些键或原子，再部分优化。
不少文献中采用前两种方法，而第三种方法，起码在配合物；领域我还没见过。
那么，请问大家一般是怎么处理的。谢谢。
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1楼 2011-07-23 01:17:53
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
1141312楼: Originally posted by oyljw at 2011-08-11 09:25:49
全优化了  但是结果达不到审稿人要求 （要求键长键角相对误差在%1一下）正心急火燎中........................................

请问您的相对误差是怎么来的？是否把优化后的结构与晶体结构相比？
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9楼2012-08-07 16:45:04
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
全优化了  但是结果达不到审稿人要求 （要求键长键角相对误差在%1一下）正心急火燎中........................................
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独立之精神自由之思想
2楼2011-08-11 09:25:49
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angiu

银虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 2011-08-11 17:55:00
如果取代基太大或者对反应影响很小,譬如说做手性催化的立体中心,那开始做机理能量时先用小基组代替,有必要再还原完全的结构
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-08-11 16:59:49
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ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by angiu at 2011-08-11 16:59:49:
如果取代基太大或者对反应影响很小,譬如说做手性催化的立体中心,那开始做机理能量时先用小基组代替,有必要再还原完全的结构

是“小基组”还是“小基团”？
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4楼2011-08-11 22:59:04
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