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zsl_321123

铁虫 (正式写手)

[交流] 搞第一性原理计算两年了，竟然被初学者给问倒了，发50金币征集意见！

问题如下：

两个分子：

model1：1-戊烯（分子式C5H10）

model2：环戊烷（C5H10）

1. 两个分子可以看成我们平时量化计算中的cluster。现在用dmol判断其稳定性，同过计算两者的总能量（或者binding energy，或者其它性质）不一样。依据我们第一性原理计算中的判断，肯定一个更稳定，一个不稳定。
2. 大家又都见过这种情形，如果你构建两个结构模型（分子式相同），审稿人会认为实验上能合成总能量更负的那个。另一个就被判为死刑，说不稳定，就没意义了。

那综合1,2来看，是否有矛盾呢，这里的model1和model2在实验上已经合成出来了。而且分子式相同，而且同为cluster，稳定性却不相同，为什么都能合成出来呢？还有这两个比较稳定性的意义大吗？

问题重点：假如我又设计出一个新的model3，而且分子式也是C5H10的话，我怎样用DFT计算来判断这种物质能否在实验上合成，能否稳定存在，可以用哪些物理量来表示呢？请大家积极参加讨论，幼稚问题，忘大家不要见笑！

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1楼 2011-07-22 14:35:21

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zylong788

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1657.3
帖子: 258
在线: 49.3小时
虫号: 527509

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zsl_321123(金币+5): 感谢建议！ 2011-07-22 15:26:34
uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-07-22 15:28:48

同分异构体实验上合成很正常，因为实验中采取的实验条件并不一定是计算中选取的最低能量，所以，实验上合成只能代表该能量状态均大于两种分子合成的最低能量，并不能以此来判断合成的就是最稳定的。楼主可能是只做计算，因此没有考虑实验中采用的条件往往是高于理论计算最低能量；另外，如果楼主能设计出model3，实验中合成出来，如上，仍然不能说明什么问题，如果试验中合成不出来，可能的原因之一是该结构的合成能量较高，但并不排除其它可能

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5楼2011-07-22 15:12:45

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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zsl_321123(金币+5): 的确不错，可是假如这两个之间过渡态搜索不到怎么办呢，搜不到说明了什么呢？ 2011-07-22 15:25:05

物质的稳定性貌似可以分为热力学稳定和动力学稳定，如果单纯从能量方面考虑即热力学稳定；同时从计算角度考虑，可以计算不同异构体的转化势垒，势垒很大，则可能各种构型都存在，即动力学稳定；也就是在一定实验条件下合成的物质可能处于某个虽然不是能量最低但是向其他构型转化的势垒又太大而不发生变化，从而能够合成，并且稳定存在。个人浅见，欢迎批评指正。呵呵