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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 热点前沿问题讨论 » 如何通过第一性原理计算来证明π键的存在
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dxcharlary

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[求助] 如何通过第一性原理计算来证明π键的存在

比如说石墨，如何证明其是有π键存在的呢？通过电子密度图吗？不过电子密度图好像很难看出来。看到的都是sp2的sigma键。最好有相关的文献。
单个分子的好像比较容易，可晶体结构怎么办呢？

[ Last edited by dxcharlary on 2011-11-8 at 09:30 ]
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1楼2011-11-07 21:55:36
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xfzhou

铁杆木虫 (初入文坛)
★ ★
fzx2008(金币+2): 鼓励交流 2011-11-08 16:15:15
Phys. Rev. B 77, 064103 (2008)
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2楼2011-11-08 14:04:36
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cenwanglai

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★ ★
dxcharlary(金币+20): 好吧，其实ms的orbital可以看。PARCHG也行。不过晶体里面π键真的不好分辨。基本上和单个的p电子是一样的。 2011-11-08 21:47:07
贺仪(金币+2): 很好的建议！ 2011-11-09 08:38:03
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2楼: Originally posted by xfzhou at 2011-11-08 14:04:36:
Phys. Rev. B 77, 064103 (2008)

在pdos上找出pi键的能量位置范围，然后在这个范围算PARCHG，然后根据PARCHG画电荷密度图就有了。从空间几何形状上就可以判断是不是pi键。

喔，我的是VASP.如果是Gaussian或者MS的话，说不定可以直接看呢。
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3楼2011-11-08 20:46:01
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dxcharlary

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3楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-08 20:46:01:
在pdos上找出pi键的能量位置范围，然后在这个范围算PARCHG，然后根据PARCHG画电荷密度图就有了。从空间几何形状上就可以判断是不是pi键。

喔，我的是VASP.如果是Gaussian或者MS的话，说不定可以直接看呢。

问题是有了PARCHG之后怎么作图呢？尤其是切片图？
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4楼2011-11-09 17:04:25
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cenwanglai

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【答案】应助回帖

★ ★
贺仪(金币+2): VESTA可以直接处理PARCHG.多谢建议！ 2011-11-09 17:40:20
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4楼: Originally posted by dxcharlary at 2011-11-09 17:04:25:
问题是有了PARCHG之后怎么作图呢？尤其是切片图？

把PARCHG文件名修改成CHGCAR，一样处理。说不定VESTA可以直接处理PARCHG.

可以用lev00做截面，也可以用vesta做截面。也可以转成MS可读的，用MS做截面。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-11-9 at 17:08 ]
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5楼2011-11-09 17:07:43
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dxcharlary

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引用回帖:
5楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-09 17:07:43:
把PARCHG文件名修改成CHGCAR，一样处理。说不定VESTA可以直接处理PARCHG.

可以用lev00做截面，也可以用vesta做截面。也可以转成MS可读的，用MS做截面。
[ Last edited by cenwanglai on 2011-11-9 at ...

有什么办法能够把CHGCAR变成MS可读的？
medea要是能直接读CHGCAR就好了。
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6楼2011-11-09 21:14:11
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cenwanglai

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【答案】应助回帖

★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-11-10 09:54:45
引用回帖:
6楼: Originally posted by dxcharlary at 2011-11-09 21:14:11:
有什么办法能够把CHGCAR变成MS可读的？
medea要是能直接读CHGCAR就好了。

写代码。 似乎要转换成.grd格式。

以前看到过这样的Fortran程序，但是一直没有调试通，就放着了。你找找看？
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7楼2011-11-09 21:19:53
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redskywei

木虫 (著名写手)

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★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-11-10 14:48:06
能带图就直接可以啊，派电子的能的扩散性强，在能带里带宽大，尤其理想的最小元胞，应该一眼就可以看出来啊。难道非要用轨道来证明？
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坠入无边的网~~
8楼2011-11-10 10:47:20
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dxcharlary

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7楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-11-09 21:19:53:
写代码。 似乎要转换成.grd格式。

以前看到过这样的Fortran程序，但是一直没有调试通，就放着了。你找找看？

为什么CHGCAR和PARCHG算出来的都是这样的。。。
另外ELF和CHG有什么区别和联系呢？为什么用medeA算出了的CHG都是以原子为中心的一个球一个球的？不过ELF还好。

vesta CHGCAR
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9楼2011-11-10 11:11:33
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cenwanglai

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★ ★ ★
youzhizhe(金币+3, 1ST强帖+1): 谢谢交流。授予EPI一枚。 2011-11-10 14:48:32
引用回帖:
9楼: Originally posted by dxcharlary at 2011-11-10 11:11:33:
为什么CHGCAR和PARCHG算出来的都是这样的。。。
另外ELF和CHG有什么区别和联系呢？为什么用medeA算出了的CHG都是以原子为中心的一个球一个球的？不过ELF还好。

[ ...

ELF描述的是原子间的相互作用强弱的，所以不是以原子为中心的球球。

CHGCAR当然是以原子为中心的球球，因为原子间的电子是少数，而局域到原子内的电子是多数。

PARCHG给出的是你指定的能量水平的电荷密度。如果你给出的是占据态的pi键，那估计是外层电子，所以显示出来的就跟CHGCAR一样的。

所有这些电荷密度，你需要仔细判断显示范围。只有合适的范围和合适的显示效果，才能把结果更好的展示出来。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-11-10 at 14:54 ]
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10楼2011-11-10 11:18:31
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