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lyl163com

金虫 (正式写手)

[求助] 晶胞如何转换

前几天收一个数据，还原数据时用的是六方晶系，但是晶体无法解析，让一个老师帮我解析了，但是解析出的结构是立方晶系，我想着是不是在解析的过程中可以把晶胞转换呢？因为不好意思再劳烦那老师，所以在这里问问大牛们，晶胞是不是可以转换？如果是晶胞该如何转换？谢谢
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1楼 2011-07-04 18:22:34
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0507030032

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

lyl163com(金币+5): 2011-07-04 19:38:17
引用回帖:
Originally posted by lyl163com at 2011-07-04 18:22:34:
前几天收一个数据，还原数据时用的是六方晶系，但是晶体无法解析，让一个老师帮我解析了，但是解析出的结构是立方晶系，我想着是不是在解析的过程中可以把晶胞转换呢？因为不好意思再劳烦那老师，所以在这里问问大 ...

是的，用platon就可以的，
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2楼2011-07-04 18:53:23
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lyl163com

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 0507030032 at 2011-07-04 18:53:23:
是的，用platon就可以的，

能具体说一下步骤吗？还有就是转换成什么样的晶系有什么的依据吗？
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3楼2011-07-04 19:39:28
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0507030032

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

lyl163com(金币+5): 2011-07-04 20:35:29
引用回帖:
Originally posted by lyl163com at 2011-07-04 19:39:28:
能具体说一下步骤吗？还有就是转换成什么样的晶系有什么的依据吗？

很多情况下，Xprep程序提示的高低不同的空间群，我们一般按默认的空间群去解，但直接按高的空间群无法显示出分子，或只能看到一部分，这时可降低空间群，先解出绝大部分结构，选择res或ins文件，点击platon中的publish下的addysm计算空间群，如提示有更高对称性的空间群，则原先空间群有误，需进行转化，publish下的addsym shelx可以生成同名的res，将原先的覆盖，在此基础上继续精修即可。
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4楼2011-07-04 19:55:29
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

lyl163com(金币+5): 2011-07-08 18:25:10
晶胞空间群的确定的确是晶体解析的关键之一，有软件 可以解决这一问题，解析完毕后会提示你空间群有问题应该转换为....空间群 ，照其提示做就OK了。
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5楼2011-07-04 20:35:03
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lyl163com

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 0507030032 at 2011-07-04 19:55:29:
很多情况下，Xprep程序提示的高低不同的空间群，我们一般按默认的空间群去解，但直接按高的空间群无法显示出分子，或只能看到一部分，这时可降低空间群，先解出绝大部分结构，选择res或ins文件，点击platon中的 ...

可能我没有说清我的问题，一般情况用platon转换了空间群，晶胞参数应该不会变化，我的晶体是晶胞参数发生了变化，使得结构所处的晶系发生了变化？由六方变成了立方！
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6楼2011-07-04 20:38:58
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

六方与立方只是误差之间的关系。
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7楼2011-07-04 20:48:27
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0507030032

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

lyl163com(金币+10): 2011-07-04 20:56:21
引用回帖:
Originally posted by lyl163com at 2011-07-04 20:38:58:
可能我没有说清我的问题，一般情况用platon转换了空间群，晶胞参数应该不会变化，我的晶体是晶胞参数发生了变化，使得结构所处的晶系发生了变化？由六方变成了立方！

那老师他帮你解的结构有问题吗？如果没问题的话，有可能就是立方晶系了，有时还原数据按默认的晶系解不出来，可以尝试选择别的晶系。
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8楼2011-07-04 20:55:16
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