| 查看: 2078 | 回复: 11 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
全原子力场与RDF的分析是否有关系？如何对原子基团或者分子进行RDF分析？
|
||
|
吉布斯系统Monte Carlo模拟的新手，想问大侠们一个问题。选择全原子力场NERD进行的轻烃类气液相平衡的模拟，想对平衡的液相进行RDF分析，不知是分析分子（或者原子基团）之间的RDF还是原子之间的RDF？这与所选的力场是否有关系，选择全原子力场就必须对原子基团之间进行分析还是可以对单一原子分析？ 还有一个很头疼的问题，选择原子作为SETS比较容易，但是选择分子或者基团的话，通过find patterns 可以选择分子，但不能选择基团，而且 这种sets 在RDF 或者是PCF中不能分析啊, 如何选择原子基团或者是分子并进行RDF分析呢?   |
回复此楼» 猜你喜欢
299求调剂
已经有5人回复
-
材料专业求调剂
已经有6人回复
-
311求调剂
已经有5人回复
-
317求调剂
已经有13人回复
-
296求调剂
已经有10人回复
-
274求调剂
已经有10人回复
-
22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术
已经有4人回复
-
材料专硕英一数二306
已经有7人回复
-
南京大学化学376求调剂
已经有6人回复
-
南昌大学材料专硕311分求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于引物设计
已经有9人回复
- 急问无规共聚物是不是很难提纯？还有能实现数目的可控吗？
已经有6人回复
- 求一高分子合成PMMA-b-PEG嵌段聚合物
已经有20人回复
- 怎么测样品中氮化铝的含量，或者氮的含量？
已经有15人回复
- 6%变性聚丙烯酰胺凝胶总是凝的不好 求指点 急啊 谢谢了
已经有43人回复
- 分子生物学投稿，求助~
已经有4人回复
- 各位大侠：GPC测试步骤
已经有15人回复
- 酮和氨基反应生成希夫碱的反应
已经有3人回复
- 羟乙基磺酸钠有什么溶剂可以溶解啊
已经有11人回复
- 研究细胞信号转导通路，建立细胞系，是否一定要敲出细胞内源性蛋白分子？
已经有8人回复
- 热固性树脂 热塑性树脂
已经有22人回复
5楼2011-06-29 16:07:20
yahoohoo
铁杆木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 10
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 1.55
- 金币: 7632.4
- 散金: 251
- 红花: 4
- 帖子: 1176
- 在线: 167小时
- 虫号: 74894
- 注册: 2005-06-15
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2011-06-29 01:32:28
 嗯，就是说用如果用NERD（全原子力场）是可以分析原子之间的RDF的，我想分析基团之间的RDF，但是不会选中原子基团作为SETS，使用的是MS4.0中Forcite/Anaysisi/Radial distribution function,用edit/select atoms还是edit/find patterns来选择基团? 具体怎么怎么选? 大侠能指点一下吗? 还想问大侠一个问题。下图是我分析原子之间的一个RDF，怎么调整都是很粗糙，我看文献上的都是很平滑的漂亮的曲线，由于毕业限制需要发文章，所以很急，能糊弄过去就行啊 ，希望您能提出宝贵意见.提这么多的问题，真是麻烦大侠了，大侠肯相助，我可以把所以的金币都赠送给你  不胜感激！    |
3楼2011-06-29 07:40:52
yahoohoo
铁杆木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 10
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 1.55
- 金币: 7632.4
- 散金: 251
- 红花: 4
- 帖子: 1176
- 在线: 167小时
- 虫号: 74894
- 注册: 2005-06-15
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-06-29 13:10:35
