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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 天然药物化学 » 如何确定该结构的相对构型
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wenyisj

金虫 (小有名气)

[求助] 如何确定该结构的相对构型

各位大侠帮忙看一下，如何确定改结构的相对构型？noesy我也做了，但是发现还是定不了。各位有什么高见？
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1楼 2011-06-15 14:52:13
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
novus(金币+1, EPI+1): 多谢指教！ 2011-06-15 19:52:24
链上的这个手性碳除了单晶和Mosher定不了，发文章非得要你定的话你就只能和文献进行碳谱比对.
六圆环为船式构象，而且链必须在平伏键上，这样3位和6位就确定了。
5位甲基如果冲外的话可能会与3位H有弱相关，（也可能没有）如果没有的话，4位的两个H是不一样的，你搭模型可以知道当它和3位H偶合时候偶合常数不一样，可以看5位甲基和这两个H的相关哪个比较强（可能都有相关），可以确定5位的相对构型。
绝对构型的话你可以尝试水解后做Mosher或单晶。（采用酶水解）
最后请问下你这个化合物从哪个植物里分到的？
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分离、分离
2楼2011-06-15 19:06:47
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stevenabing

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
wenyisj(金币+1): 2011-06-16 23:56:46
jiangchunyong(金币+1): 谢谢！ 2011-06-17 00:05:23
单晶衍射也不一定能解决问题，因为第一你的化合物中最重的原子是O，所以要确定绝对构型，最起码测定时要用铜靶，其产生的X-射线波长比现在最常见的Mo靶要长些，这只是一个必要条件，其次，还得看你的晶体质量，若晶体质量好，又用Cu靶，得到的flack因子接近零，那么就可以确定绝对构型，但是还有一点你的化合物必须是光学纯样品，那么通过单晶衍射确定的绝对构型公信度最好，最可靠。
通过单晶衍射必须获得晶体，若无法获得晶体，就可以用其他方法，你的化合物可以尝试水解后用mosher方法测定。
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3楼2011-06-16 08:38:24
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-15 19:06:47:
链上的这个手性碳除了单晶和Mosher定不了，发文章非得要你定的话你就只能和文献进行碳谱比对.
六圆环为船式构象，而且链必须在平伏键上，这样3位和6位就确定了。
5位甲基如果冲外的话可能会与3位H有弱相关，（也 ...

首先，谢谢您，这么用心的分析我的化合物。
1 链上的手性碳，文献中只报道了苷元，结果两种情况下该碳的化学位移是相同的，所以，它的构型定不下来（绝对和相对）
2，链未必在平伏键上，只是通过文献苷元的相对构型，画的这个，可是通过搭模型，发现这个环已经是刚性船式构象，在桥环向外的情况下，链也向外，所以，其他几个位置还是无法定（3和6）
3,5位甲基找不到和3位H的noesy，很感谢这个从耦合常数区分两个secH的方法
4，至于植物，不好意思，不方便透漏，不过，这类型的化合物现在分到的并不多，应该不超过5个，其苷元多是从烟草挥发性成分中分到。
再次，谢谢您的建议。
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4楼2011-06-16 23:56:03
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by stevenabing at 2011-06-16 08:38:24:
单晶衍射也不一定能解决问题，因为第一你的化合物中最重的原子是O，所以要确定绝对构型，最起码测定时要用铜靶，其产生的X-射线波长比现在最常见的Mo靶要长些，这只是一个必要条件，其次，还得看你的晶体质量，若 ...

非常感谢您的建议，绝对构型这方面我真了解比较少，回头，好好看看文献，不过，因为量比较少，现在只能试着先解决相对构型的问题。
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5楼2011-06-16 23:57:59
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
karl2100(金币+1): 3Q 2011-06-17 19:12:48
你还是上ssaifinder查下吧，如果我没记错的话，Biochemical Systematics and Ecology,这个杂志上有你这个化合物
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分离、分离
6楼2011-06-17 10:51:54
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by wenyisj at 2011-06-16 23:56:03:
首先，谢谢您，这么用心的分析我的化合物。
1 链上的手性碳，文献中只报道了苷元，结果两种情况下该碳的化学位移是相同的，所以，它的构型定不下来（绝对和相对）
2，链未必在平伏键上，只是通过文献苷元的相 ...

我还想说下啊，6位的直立键已经成氧环了，怎么还确定不了链在平伏键上呢，你把氧桥打开，你就清楚哪个是直立哪个是平伏了，
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分离、分离
7楼2011-06-17 11:02:57
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 10:51:54:
你还是上ssaifinder查下吧，如果我没记错的话，Biochemical Systematics and Ecology,这个杂志上有你这个化合物

谢谢你，你好人做到底。能把这篇文章给我发一下吗，我只查到这个苷元的，苷的有一篇是JHRC还和我这个化合物的烯烃构型不同，而且全文还没找到。
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8楼2011-06-17 17:54:54
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 11:02:57:
我还想说下啊，6位的直立键已经成氧环了，怎么还确定不了链在平伏键上呢，你把氧桥打开，你就清楚哪个是直立哪个是平伏了，

可是6位是我暂时这么画，并没定下来。
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9楼2011-06-17 17:55:15
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by wenyisj at 2011-06-17 17:55:15:
可是6位是我暂时这么画，并没定下来。

哎，我的意思是，船式结构只有两个对位的直立键才能成氧环~~~~
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分离、分离
10楼2011-06-17 20:09:12
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