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wenyisj

金虫 (小有名气)

[求助] 如何确定该结构的相对构型

各位大侠帮忙看一下,如何确定改结构的相对构型?noesy我也做了,但是发现还是定不了。各位有什么高见?
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


novus(金币+1, EPI+1): 多谢指教! 2011-06-15 19:52:24
链上的这个手性碳除了单晶和Mosher定不了,发文章非得要你定的话你就只能和文献进行碳谱比对.
六圆环为船式构象,而且链必须在平伏键上,这样3位和6位就确定了。
5位甲基如果冲外的话可能会与3位H有弱相关,(也可能没有)如果没有的话,4位的两个H是不一样的,你搭模型可以知道当它和3位H偶合时候偶合常数不一样,可以看5位甲基和这两个H的相关哪个比较强(可能都有相关),可以确定5位的相对构型。
绝对构型的话你可以尝试水解后做Mosher或单晶。(采用酶水解)
最后请问下你这个化合物从哪个植物里分到的?
分离、分离
2楼2011-06-15 19:06:47
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stevenabing

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


wenyisj(金币+1): 2011-06-16 23:56:46
jiangchunyong(金币+1): 谢谢! 2011-06-17 00:05:23
单晶衍射也不一定能解决问题,因为第一你的化合物中最重的原子是O,所以要确定绝对构型,最起码测定时要用铜靶,其产生的X-射线波长比现在最常见的Mo靶要长些,这只是一个必要条件,其次,还得看你的晶体质量,若晶体质量好,又用Cu靶,得到的flack因子接近零,那么就可以确定绝对构型,但是还有一点你的化合物必须是光学纯样品,那么通过单晶衍射确定的绝对构型公信度最好,最可靠。
通过单晶衍射必须获得晶体,若无法获得晶体,就可以用其他方法,你的化合物可以尝试水解后用mosher方法测定。
3楼2011-06-16 08:38:24
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wenyisj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-15 19:06:47:
链上的这个手性碳除了单晶和Mosher定不了,发文章非得要你定的话你就只能和文献进行碳谱比对.
六圆环为船式构象,而且链必须在平伏键上,这样3位和6位就确定了。
5位甲基如果冲外的话可能会与3位H有弱相关,(也 ...

首先,谢谢您,这么用心的分析我的化合物。
1 链上的手性碳,文献中只报道了苷元,结果两种情况下该碳的化学位移是相同的,所以,它的构型定不下来(绝对和相对)
2,链未必在平伏键上,只是通过文献苷元的相对构型,画的这个,可是通过搭模型,发现这个环已经是刚性船式构象,在桥环向外的情况下,链也向外,所以,其他几个位置还是无法定(3和6)
3,5位甲基找不到和3位H的noesy,很感谢这个从耦合常数区分两个secH的方法
4,至于植物,不好意思,不方便透漏,不过,这类型的化合物现在分到的并不多,应该不超过5个,其苷元多是从烟草挥发性成分中分到。
再次,谢谢您的建议。
4楼2011-06-16 23:56:03
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wenyisj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by stevenabing at 2011-06-16 08:38:24:
单晶衍射也不一定能解决问题,因为第一你的化合物中最重的原子是O,所以要确定绝对构型,最起码测定时要用铜靶,其产生的X-射线波长比现在最常见的Mo靶要长些,这只是一个必要条件,其次,还得看你的晶体质量,若 ...

非常感谢您的建议,绝对构型这方面我真了解比较少,回头,好好看看文献,不过,因为量比较少,现在只能试着先解决相对构型的问题。
5楼2011-06-16 23:57:59
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


karl2100(金币+1): 3Q 2011-06-17 19:12:48
你还是上ssaifinder查下吧,如果我没记错的话,Biochemical Systematics and Ecology,这个杂志上有你这个化合物
分离、分离
6楼2011-06-17 10:51:54
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by wenyisj at 2011-06-16 23:56:03:
首先,谢谢您,这么用心的分析我的化合物。
1 链上的手性碳,文献中只报道了苷元,结果两种情况下该碳的化学位移是相同的,所以,它的构型定不下来(绝对和相对)
2,链未必在平伏键上,只是通过文献苷元的相 ...

我还想说下啊,6位的直立键已经成氧环了,怎么还确定不了链在平伏键上呢,你把氧桥打开,你就清楚哪个是直立哪个是平伏了,
分离、分离
7楼2011-06-17 11:02:57
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wenyisj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 10:51:54:
你还是上ssaifinder查下吧,如果我没记错的话,Biochemical Systematics and Ecology,这个杂志上有你这个化合物

谢谢你,你好人做到底。能把这篇文章给我发一下吗,我只查到这个苷元的,苷的有一篇是JHRC还和我这个化合物的烯烃构型不同,而且全文还没找到。
8楼2011-06-17 17:54:54
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wenyisj

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 11:02:57:
我还想说下啊,6位的直立键已经成氧环了,怎么还确定不了链在平伏键上呢,你把氧桥打开,你就清楚哪个是直立哪个是平伏了,

可是6位是我暂时这么画,并没定下来。
9楼2011-06-17 17:55:15
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xiaoxiao270

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by wenyisj at 2011-06-17 17:55:15:
可是6位是我暂时这么画,并没定下来。

哎,我的意思是,船式结构只有两个对位的直立键才能成氧环~~~~
分离、分离
10楼2011-06-17 20:09:12
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