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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 天然药物化学 » 如何确定该结构的相对构型
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wenyisj

金虫 (小有名气)

[求助] 如何确定该结构的相对构型

各位大侠帮忙看一下，如何确定改结构的相对构型？noesy我也做了，但是发现还是定不了。各位有什么高见？
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1楼 2011-06-15 14:52:13
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-15 19:06:47:
链上的这个手性碳除了单晶和Mosher定不了，发文章非得要你定的话你就只能和文献进行碳谱比对.
六圆环为船式构象，而且链必须在平伏键上，这样3位和6位就确定了。
5位甲基如果冲外的话可能会与3位H有弱相关，（也 ...

首先，谢谢您，这么用心的分析我的化合物。
1 链上的手性碳，文献中只报道了苷元，结果两种情况下该碳的化学位移是相同的，所以，它的构型定不下来（绝对和相对）
2，链未必在平伏键上，只是通过文献苷元的相对构型，画的这个，可是通过搭模型，发现这个环已经是刚性船式构象，在桥环向外的情况下，链也向外，所以，其他几个位置还是无法定（3和6）
3,5位甲基找不到和3位H的noesy，很感谢这个从耦合常数区分两个secH的方法
4，至于植物，不好意思，不方便透漏，不过，这类型的化合物现在分到的并不多，应该不超过5个，其苷元多是从烟草挥发性成分中分到。
再次，谢谢您的建议。
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4楼2011-06-16 23:56:03
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by stevenabing at 2011-06-16 08:38:24:
单晶衍射也不一定能解决问题，因为第一你的化合物中最重的原子是O，所以要确定绝对构型，最起码测定时要用铜靶，其产生的X-射线波长比现在最常见的Mo靶要长些，这只是一个必要条件，其次，还得看你的晶体质量，若 ...

非常感谢您的建议，绝对构型这方面我真了解比较少，回头，好好看看文献，不过，因为量比较少，现在只能试着先解决相对构型的问题。
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5楼2011-06-16 23:57:59
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 10:51:54:
你还是上ssaifinder查下吧，如果我没记错的话，Biochemical Systematics and Ecology,这个杂志上有你这个化合物

谢谢你，你好人做到底。能把这篇文章给我发一下吗，我只查到这个苷元的，苷的有一篇是JHRC还和我这个化合物的烯烃构型不同，而且全文还没找到。
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8楼2011-06-17 17:54:54
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 11:02:57:
我还想说下啊，6位的直立键已经成氧环了，怎么还确定不了链在平伏键上呢，你把氧桥打开，你就清楚哪个是直立哪个是平伏了，

可是6位是我暂时这么画，并没定下来。
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9楼2011-06-17 17:55:15
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 20:26:55:
文献先给你吧，以后还是自己查的好

非常感谢，只是非常想看一下您的这篇文献，手头有几篇，但是对3,5,6几个位置的手性碳定的都是相对构型，而且均是以S*和R*的形式写的，有点不明白这表示的是什么意思，对于这一点，想从您这篇文献看看究竟，不知道您是怎么理解这一点的，非常希望您能不吝赐教！谢谢！
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12楼2011-06-17 22:25:31
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wenyisj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao270 at 2011-06-17 22:34:16:
加星号就是相对构型的一种写法，当不能完全用α、β表示相对构型，又想在命名中表示出来相对构型时候就用这种办法，你要的文献我已经发给你了，没看到吧

你好，方便聊一下吗？我想跟您再交流一下我这儿的一篇文献，您如果对这个感兴趣的话，麻烦您看一下这篇文献，我觉得，你的这篇文献对于绝对构型定的比较简单，而且只做了1D2D谱，我不知道他是怎么和文献对出的这个绝对构型。而且原始文献是篇japanese的，我没见过这个杂志，也查不到。谢谢。
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14楼2011-06-17 22:45:33
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