应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gamess/Q-Chem » fragment molecilar orbital method 方法
51/1返回列表
查看: 1511  |  回复: 6
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

YJY1234

金虫 (初入文坛)

[求助] fragment molecilar orbital method 方法

用gamess中的FMO2/TDDFT(LCBLYP)模块计算叶绿素分子的激发态能量时，用6-31g基组时，算到双体都不能收敛，但用sto-3g则可以正常结束，这是什么原因，怎样才能解决呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2011-06-11 15:16:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

YJY1234

金虫 (初入文坛)
FMO TDDFT对inter-fragment excitation的计算是完全失效的？这是什么意思呢？
在文献J. C. P 127 104108（2007）中，作者已经用FMO-TDDFT(LC-BYYP/G-31G*)计算叶黄素PYP的激发态能量。
赞一下 回复此楼
3楼2011-06-13 08:20:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

toyidi

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 谢谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-06-11 17:15:22
YJY1234(金币+10): 2011-06-13 08:21:31
如果计算过程没错的话，就是fragment的选取造成的。
建议fragment取大点，因为FMO TDDFT对inter-fragment excitation的计算是完全失效的。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-06-11 16:33:45
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

toyidi

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by YJY1234 at 2011-06-13 08:20:59:
FMO TDDFT对inter-fragment excitation的计算是完全失效的？这是什么意思呢？
在文献J. C. P 127 104108（2007）中，作者已经用FMO-TDDFT(LC-BYYP/G-31G*)计算叶黄素PYP的激发态能量。

意思就是，当最低单重激发态并不发生在所选取的central fragment上时，而是从一个fragment跃迁到另一个fragment上，那么它所算的激发能就完全错误。不信可以试下LDA，GGA之类的纯泛函，和整体计算的结果相差十万八千里。LC泛函修正可以确保最低单重激发态S1发生在central fragment上，不过这也是特殊情况，不具有普适性，S2及其他激发态可能就是上面提到的inter-fragment excitation，所以他们不报导。

你说的不收敛是指的FMO DFT 基态还是激发态计算。如果是激发态，就是每个子体系的常规TDDFT计算不收敛，这种情况很少见但还是可能发生的，但是文献既然报导了结果，可能还是你在计算细节上出了问题。
赞一下 回复此楼
4楼2011-06-13 22:47:40
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

YJY1234

金虫 (初入文坛)
计算过程出了问题？同样的结构，关键词也是一样的，只是变化了基组。
用sto-3g得出的结果是：state  excitation/ev   transition dipole(a.u.)      osc.
                                1        2.051       -2.7144  -0.9013  0.2738     0.415
用6-31g得出的结果是：state  excitation/ev   transition dipole(a.u.)      osc.
                                1        ****       0.0000  0.0000  0.000     0.000
用LC-BLYP/6-31g计算时，激发态单体的能量就出现错误了。
赞一下 回复此楼
5楼2011-06-15 16:57:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭