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chenliangqiang

金虫 (小有名气)

[求助] 如何判断各种微生物对某一产物的贡献?希望得到帮助!

Sample Text如果几种微生物都能代谢某一种产物,那么如果将这几种微生物一起培养,如何分析产生该产物的贡献率?
希望能得到大家的帮助啊
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笨宝宝
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bear0329

金虫 (正式写手)

这个貌似很复杂啊,我也很想知道啊,求高人指点
以马内利!
2楼2011-06-10 22:24:28
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chenliangqiang

金虫 (小有名气)

是啊 是啊
笨宝宝
3楼2011-06-10 22:49:51
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redbull2011

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-06-11 16:37:09
chenliangqiang(金币+1): 这个应该是不太行的 2011-06-16 10:22:32
是否可以这样:
首先单独培养,看在同样条件下每种微生物的生产效率;混合在一起后,检测它们各自在混合群体中所占的数量比例。
4楼2011-06-10 22:58:58
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bear0329

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励交流 2011-06-11 16:37:14
chenliangqiang(金币+3): 恩 我也是这么考虑的 应该不是简单的加和作用 2011-06-16 10:16:57
引用回帖:
Originally posted by redbull2011 at 2011-06-10 22:58:58:
是否可以这样:
首先单独培养,看在同样条件下每种微生物的生产效率;混合在一起后,检测它们各自在混合群体中所占的数量比例。

我认为,单独培养和混合培养的条件是不一样的,首先细胞间的信息传递,是否会干扰别的种类微生物的生理活动?还有就是,微生物产生的代谢产物会不会影响其他微生物个体的生理代谢?总之,同一群体和不同群体混合所产生的群体效应是不一样的。所以说很难定量其贡献率。
以马内利!
5楼2011-06-10 23:32:39
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xinongfish

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励交流 2011-06-11 16:37:18
rainwander(EPI+1): 2011-06-11 16:37:24
chenliangqiang(金币+3): 恩,非常赞同!对于同位素,我好像听说过SIP(稳定性同位素),但是具体的不太清楚。对于第二个,估计更好实行一些吧,但具体的想法,还需要大家的献计献策 2011-06-16 10:25:00
有两点不太成熟的建议:
1 首先要分析你的产物,如果可能的话,选择一个合适的同位素,用不同的同位素标记,或许可以分开不同微生物产生的同一产物。
2 另外就是能不能找到控制合成该产物的基因,通过Real-time PCR等检测RNA的表达量,来间接监控产物的合成量。
6楼2011-06-11 08:33:33
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梧桐小雨

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
rainwander(金币+3, EPI+1): 鼓励交流 2011-06-12 22:07:43
chenliangqiang(金币+3): 考虑的很好啊,俺没有想到。不过这个产物是一样的,不同微生物都要共同的途径生成该产物 2011-06-16 10:29:16
引用回帖:
Originally posted by xinongfish at 2011-06-11 08:33:33:
有两点不太成熟的建议:
1 首先要分析你的产物,如果可能的话,选择一个合适的同位素,用不同的同位素标记,或许可以分开不同微生物产生的同一产物。
2 另外就是能不能找到控制合成该产物的基因,通过Real-time ...

首先,先提出几点疑问:1、如何选择合适的同位素去标记蛋白产物,因为蛋白组成为一般稳定为O、N、C、S、P
                                 2、控制一种产物生成的基因一般同源性很高,特别是真核生物的单顺反子结构较为简单,很难找到合适的特殊各自特意的调控基因


发点议论,请大侠指点:
                 1、能否对个别共同发酵的微生物进行基因重组,使其产物带上标记蛋白,类似报告基因的效果,从而达到区分效果
                 2、还是基因重组的方法,通过Real-Time PCR实时定量检测mRNA的含量变化
7楼2011-06-12 10:11:44
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8楼2011-06-12 10:46:42
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lzhaowin

木虫 (小有名气)

学习中~大家都很有想法啊~
9楼2011-06-13 12:32:59
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charon1982

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

chenliangqiang(金币+3): 这招切实可行。我想可以先试试这个方法,希望能进一步指教啊 2011-06-16 10:30:48
利用统计学,比如响应面的方法,采用不同接种量,分析产物产量,最终分析贡献
帮助虫友,提升自己
10楼2011-06-13 12:52:45
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