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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

[求助] 巢式PCR

最近一直在用巢式P可是做了很久就没有结果,想请教下,用巢式P要注意些什么
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juliana_zou11

木虫 (著名写手)

巢式很好做啊,是怎么没有结果呢
2楼2011-06-07 14:22:56
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by juliana_zou11 at 2011-06-07 14:22:56:
巢式很好做啊,是怎么没有结果呢

摸了很多梯度,可第2轮就是不出结果,是为什么那?要注意些什么,是我做的温度不合适吗?
3楼2011-06-07 14:29:35
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juliana_zou11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
睡着数绵羊(金币+1): 2011-06-07 14:43:56
lstt09nk(金币+2): 感谢参与,欢迎再来 2011-06-12 19:18:07
以下仅供参考:
1.第一轮产物电泳确定下是不是目的的
2.第二轮引物确定有没有出问题
3.PCR体系是什么样的,有没有出什么问题,如果前面两个都没问题,这里肯定需要优化,温度不能决定一切
4.实在不行用个梯度PCR试试
5.第一轮产物纯化一下再做第二轮试试
4楼2011-06-07 14:36:22
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by juliana_zou11 at 2011-06-07 14:36:22:
以下仅供参考:
1.第一轮产物电泳确定下是不是目的的
2.第二轮引物确定有没有出问题
3.PCR体系是什么样的,有没有出什么问题,如果前面两个都没问题,这里肯定需要优化,温度不能决定一切
4.实在不行用个梯度 ...

1,前面几次做的时候第一轮出了非特异性条带,紧接着做第2轮,温度也条了很多,还是没有结果,后面就是重复第1轮的条件,杂带也不出了。
2,反应体系:
taq plus mix        25
pri.mix(10μM)     1.8
template(700ng/μl)    1.8
h2o                  21.4
total                 50
差不多所有温度都做了。
5楼2011-06-07 14:43:30
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juliana_zou11

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

taq plus mix        这个是?taq和dNTP呢?
6楼2011-06-07 14:49:23
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by juliana_zou11 at 2011-06-07 14:49:23:
taq plus mix        这个是?taq和dNTP呢?

这个是种混合酶,里面都是加好的,整个体系只要加模板和引物就可以了。
7楼2011-06-08 09:12:47
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juliana_zou11

木虫 (著名写手)

做PCR有些时候是很邪门的,同样的条件有的人能做出来有的人做不出来,有时候今天能做出来明天做不出来,我们以前遇到这种情况有时会换个人做,有时会放一段时间再做,如果非做不可那就换个体系,换个酶试试看
还有第一轮的产物有没有经过什么处理?
8楼2011-06-08 12:54:31
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by juliana_zou11 at 2011-06-08 12:54:31:
做PCR有些时候是很邪门的,同样的条件有的人能做出来有的人做不出来,有时候今天能做出来明天做不出来,我们以前遇到这种情况有时会换个人做,有时会放一段时间再做,如果非做不可那就换个体系,换个酶试试看
还 ...

做第2轮的时候就是稀释了下模板~~
9楼2011-06-09 13:47:22
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adslye

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

睡着数绵羊(金币+1): 2011-06-11 15:20:05
引用回帖:
Originally posted by 睡着数绵羊 at 2011-06-09 13:47:22:
做第2轮的时候就是稀释了下模板~~

是高保真酶吗?
换高保真酶看看。可能第一轮的产物是非特异性产物。
引物OK吗?
是自己设计的,还是网上下的。不管怎样确认下。
10楼2011-06-10 21:48:23
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