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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by adslye at 2011-06-10 21:48:23:
是高保真酶吗?
换高保真酶看看。可能第一轮的产物是非特异性产物。
引物OK吗?
是自己设计的,还是网上下的。不管怎样确认下。

引物是自己设计的,在网上BLAST了一下还可以啊~~~
11楼2011-06-12 09:38:29
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dreammakerxg

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
lstt09nk(金币+2): 鼓励 2011-06-12 19:18:44
睡着数绵羊(金币+2): 非常感谢! 2011-06-13 14:19:24
我之前也有过你的问题,建议换个10或20微升的反应体系,还有比如你的外围引物为1和2,内部引物为3和4,那你可以不同组合试试,一轮用1和2,其产物用1和4,3和4,3和2,可能会有结果。
12楼2011-06-12 15:16:00
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dreammakerxg

铁虫 (初入文坛)

如果实在不行,重新设计外围引物好了
13楼2011-06-12 15:17:14
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lw582482481

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

睡着数绵羊(金币+2): 非常感谢! 2011-06-13 14:21:33
做巢式PCR要点:
1  首先第一轮你得有目的带存在,不论有多少杂带或者多么模糊,至少你要的大小的band存在才行(假如在第一轮PCR的时候你没有条带的话,这个时候你就得思考是你的引物或者是你的模板再或者就是你的PCR反应是否合适)。
2  将和你目的大小将近的带回收,量多的话可以纯化下,少的话直接将那段胶切下来,离心会有液体,将液体作为模板进行第二轮扩增。(这个目的是为了尽量纯化你的模板,尤其是在很较多杂带的情况下)
3   用更特异且包含在你的第一轮产物的引物进行第二轮或者进一步的PCR,方法同上面的。
4   假如你是做RACE拿到全长的话,这个我不敢保证,因为你的接头引物以及你自身的引物,以及你的逆转录的效果都会影响你能否拿到全长。
30而立
14楼2011-06-13 00:00:03
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by lw582482481 at 2011-06-13 00:00:03:
做巢式PCR要点:
1  首先第一轮你得有目的带存在,不论有多少杂带或者多么模糊,至少你要的大小的band存在才行(假如在第一轮PCR的时候你没有条带的话,这个时候你就得思考是你的引物或者是你的模板再或者就是你 ...

以前也做过把胶切下来,离心做模板P,可是什么都P不出来了。
15楼2011-06-13 14:22:50
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睡着数绵羊

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by dreammakerxg at 2011-06-12 15:16:00:
我之前也有过你的问题,建议换个10或20微升的反应体系,还有比如你的外围引物为1和2,内部引物为3和4,那你可以不同组合试试,一轮用1和2,其产物用1和4,3和4,3和2,可能会有结果。

非常感谢,我按你说的P下,还有就是引物和模板的量有什么要特别注意的嘛,比如在50的体系里,引物终浓度大概是0.1μM,模板是1μg,是以基因组为模板,这个量可以不?
16楼2011-06-13 14:25:03
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lw582482481

铜虫 (初入文坛)

所以这个就是还是我后来说的,模板问题。包括你的提取的mRNA以及逆转录,还有你模板的丰度很多因素。确实做出来虽然是比较简单但是还是需要运气的
30而立
17楼2011-06-13 18:26:37
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ljx2ljx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by juliana_zou11 at 2011-06-07 14:36:22
以下仅供参考:
1.第一轮产物电泳确定下是不是目的的
2.第二轮引物确定有没有出问题
3.PCR体系是什么样的,有没有出什么问题,如果前面两个都没问题,这里肯定需要优化,温度不能决定一切
4.实在不行用个梯度PC ...

您好,我做巢式PCR做了一周多了,用特异性引物和此模板可以扩增出来,第一轮一直没有东西,第二轮也没有东西。退火温度和模板梯度都做了,但是还是不行。可能原因有哪些呢?
18楼2013-05-16 22:14:36
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