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tianhuijuan金虫 (小有名气)
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[求助]
nested-PCR 怎样提高特异性
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最近一直在做nest-PCR,产物特异性一直上不去。很是纠结:第一次p出的产物切胶回收后,稀释5倍取1微升做模板二次PCR,结果和第一次差不多,没有出现条带,仍是smear,几乎和第一次P的结果一样。 第一次P用的模板是提取的总RNA转录为双链DNA后,与Adaptor(之前实验室用的能成功的序列)链接。(除根据Adaptor设计的两条引物外的两条引物是由三个物种的同源性手动设计的。) 两次PCR都进行了退火温度和时间,及循环数的优化,也进行过TD-PCR(间隔1度 2度都试过 ),结果仍变化不大。 PS:模板在与Adaptor连接前用其他引物验证过,有条带。 1. 连接后有smear,应该算是连接成功了吧? 2. 试剂盒Taq & Pfu 的都试过,结果是一样。那应该是引物的问题?但是不可能引物都出问题啊? 恳求各位虫虫帮忙啦. |
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