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happy111839

铜虫 (正式写手)

[求助] 哪位能教教我如何优化这个结构，谢谢


这是一个反应的产物，如何优化出两个产物在一起的结构，用的是DFT/B3LYP、6-31g(d）方法，谢谢了
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1楼 2011-05-31 21:06:54
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
好诡异 左侧的小分子是O-O键吗？
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2楼2011-05-31 21:50:58
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文？苦！主。
放一起优化，肯定会把那个=NH2中的一个H原子给夺了去。
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3楼2011-05-31 22:25:48
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happy111839

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yongma2008 at 2011-05-31 22:25:48:
放一起优化，肯定会把那个=NH2中的一个H原子给夺了去。

是，但是这是我做的反应的中间一步（实验推测机理），我该怎么解决这个问题呢
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4楼2011-05-31 22:32:18
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happy111839

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2011-05-31 21:50:58:
好诡异 左侧的小分子是O-O键吗？

是，左边的是叔丁基过氧阴离子
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5楼2011-05-31 22:32:48
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dewpoint

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

happy111839(金币+3): 2011-06-01 12:12:30
This is impossible, you mechanism is wrong. What is the barrier of this process?
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6楼2011-05-31 22:42:20
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happy111839

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dewpoint at 2011-05-31 22:42:20:
This is impossible, you mechanism is wrong. What is the barrier of this process?

这是类似反应的机理（实验推测）我优化第一步产物时就优化不出来，谢谢了
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7楼2011-05-31 22:48:36
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tty

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

happy111839(金币+3): 2011-06-03 11:22:27
happy111839(金币+3): 2011-06-30 22:24:24
你需要找到的是一个氢提取的过渡态，而不是什么放在一起优化的产物。过渡态找到以后跑一下IRC自然就得到你要的那种两个在一起的产物了。
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8楼2011-06-02 23:36:39
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happy111839

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tty at 2011-06-02 23:36:39:
你需要找到的是一个氢提取的过渡态，而不是什么放在一起优化的产物。过渡态找到以后跑一下IRC自然就得到你要的那种两个在一起的产物了。

你的意思是先用TS法找过渡态吗？
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9楼2011-06-03 11:27:47
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happy111839

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tty at 2011-06-02 23:36:39:
你需要找到的是一个氢提取的过渡态，而不是什么放在一起优化的产物。过渡态找到以后跑一下IRC自然就得到你要的那种两个在一起的产物了。

我找过渡态试了试，也是跑成中性的两种物质了
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10楼2011-06-04 08:19:53
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