| 查看: 784 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
mengyan142木虫 (小有名气)
|
[求助]
mmpbsa 出错
|
|
|
Sample Text 获得snapshot_com/rec/lig.crd文件后，输入文件如下： PREFIX snapshot PATH ./ COMPLEX 1 RECEPTOR 1 LIGAND 1 COMPT ./com.prmtop RECPT ./rec.prmtop LIGPT ./lig.prmtop GC 0 AS 0 DC 0 MM 1 GB 1 PB 1 MS 1 NM 0 @PB PROC 2 REFE 0 INDI 1.0 EXDI 80.0 SCALE 2 LINIT 1000 PRBRAD 1.4 ISTRNG 0.0 RADIOPT 0 NPOPT 1 CAVITY_SURFTEN 0.0072 CAVITY_OFFSET 0.00 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MM DIELC 1.0 @GB IGB 2 GBSA 1 SALTCON 0.00 EXTDIEL 80.0 INTDIEL 1.0 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MS PROBE 0.0 @PROGRAMS 输出文件得到snapshot.com.all.out 后就自动跳出不再继续算了，是哪里出错了，初学者请高人指点。谢谢啦～～～ |
回复此楼» 猜你喜欢
参与限项
已经有3人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有7人回复
-
实验室接单子
已经有4人回复
-
全日制（定向）博士
已经有4人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有12人回复
-
不自信的我
已经有12人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复
sinokang
至尊木虫 (职业作家)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 23496.2
- 散金: 167
- 红花: 4
- 帖子: 4187
- 在线: 243.3小时
- 虫号: 771160
- 注册: 2009-05-15
- 专业: 合成药物化学
4楼2011-06-05 15:38:47
petersen
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1241.7
- 散金: 3
- 红花: 1
- 帖子: 72
- 在线: 39.4小时
- 虫号: 998740
- 注册: 2010-04-16
- 性别: GG
- 专业: 计算机软件
2楼2011-05-27 16:41:54
mengyan142
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 823.6
- 散金: 86
- 红花: 2
- 帖子: 110
- 在线: 52.4小时
- 虫号: 1089783
- 注册: 2010-09-05
- 性别: MM
- 专业: 粉末冶金与粉体工程
好吧，输出文件sander_rec.1.out报错为：
3楼2011-05-27 16:59:47