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mengyan142木虫 (小有名气)
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mmpbsa 出错
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Sample Text 获得snapshot_com/rec/lig.crd文件后，输入文件如下： PREFIX snapshot PATH ./ COMPLEX 1 RECEPTOR 1 LIGAND 1 COMPT ./com.prmtop RECPT ./rec.prmtop LIGPT ./lig.prmtop GC 0 AS 0 DC 0 MM 1 GB 1 PB 1 MS 1 NM 0 @PB PROC 2 REFE 0 INDI 1.0 EXDI 80.0 SCALE 2 LINIT 1000 PRBRAD 1.4 ISTRNG 0.0 RADIOPT 0 NPOPT 1 CAVITY_SURFTEN 0.0072 CAVITY_OFFSET 0.00 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MM DIELC 1.0 @GB IGB 2 GBSA 1 SALTCON 0.00 EXTDIEL 80.0 INTDIEL 1.0 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MS PROBE 0.0 @PROGRAMS 输出文件得到snapshot.com.all.out 后就自动跳出不再继续算了，是哪里出错了，初学者请高人指点。谢谢啦～～～ |
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2楼2011-05-27 16:41:54
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好吧，输出文件sander_rec.1.out报错为：
3楼2011-05-27 16:59:47
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4楼2011-06-05 15:38:47