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mengyan142木虫 (小有名气)
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[求助]
mmpbsa 出错
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Sample Text 获得snapshot_com/rec/lig.crd文件后,输入文件如下: PREFIX snapshot PATH ./ COMPLEX 1 RECEPTOR 1 LIGAND 1 COMPT ./com.prmtop RECPT ./rec.prmtop LIGPT ./lig.prmtop GC 0 AS 0 DC 0 MM 1 GB 1 PB 1 MS 1 NM 0 @PB PROC 2 REFE 0 INDI 1.0 EXDI 80.0 SCALE 2 LINIT 1000 PRBRAD 1.4 ISTRNG 0.0 RADIOPT 0 NPOPT 1 CAVITY_SURFTEN 0.0072 CAVITY_OFFSET 0.00 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MM DIELC 1.0 @GB IGB 2 GBSA 1 SALTCON 0.00 EXTDIEL 80.0 INTDIEL 1.0 SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 @MS PROBE 0.0 @PROGRAMS 输出文件得到snapshot.com.all.out 后就自动跳出不再继续算了,是哪里出错了,初学者请高人指点。谢谢啦~~~ |
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