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spring965

金虫 (正式写手)

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[求助] [求助] 高斯寻找过渡态

寻找金属离子Be2+与单个配体反应的过渡态，
可能初始猜测结构给的不太好，opt=ts未找到，
1)opt=ts，在过渡态结构输入时有什么经验可循吗？哪位高手给点建议？
2）直接scan可以吗？scan时只扫描“Be-C”键长的变化，还是需要综合考虑其它？

配合物结构如下：

6          0       0.610963 -1.196107 0.000000
1          0       1.236514 -2.077356 0.000000
6          0       0.000000 0.922808 0.000000
7          0    -1.051904 0.080234 0.000000
7          0       1.069047 0.081581 0.000000
1          0    -2.045785 0.300642 0.000000
1          0       2.051648 0.340885 0.000000
7          0    -0.704260 -1.201145 0.000000
4          0    -0.024584 2.587732 0.000000

[ Last edited by spring965 on 2011-5-25 at 14:39 ]

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1楼 2011-05-25 12:09:26

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kaegi

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

spring965(金币+10): 谢谢 2011-06-03 08:51:22
spring965(金币+10): O(∩_∩)O谢谢 2011-06-17 07:39:30

引用回帖:

Originally posted by spring965 at 2011-05-25 12:09:26:
寻找金属离子Be2+与单个配体反应的过渡态，
可能初始猜测结构给的不太好，opt=ts未找到，
1)opt=ts，在过渡态结构输入时有什么经验可循吗？哪位高手给点建议？
2）直接scan可以吗？scan时只扫描“Be-C”键长 ...

从楼主的描述来看，这个应该是要找一个两个化合物结合过程中的过渡态。楼主可以用opt=modredundant命令，扫描这个成键的键长，看看是否真的存在一个过渡态。用scan也可以。如果扫描过程中有一个能量顶点，说明可能是有一个过渡态。把这个能量顶点对应的结构作为你的过渡态起始结构，用opt=(ts,calcfc,noeigentest) freq命令进行计算寻找。最后通过freq计算的频率是否有虚频以及该虚频对应的震动模式是否合理来判断。

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2楼2011-05-26 14:28:17

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