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yanyuyu

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助,PCR的电泳结果出了未知问题

这是我电泳的条带,应该在700BP和550BP出目的带,结果在最下面有很严重的拖尾,目的条带看不出来,请问各位大侠是什么原因?
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by yanyuyu at 2011-05-19 10:05:42:
这是我电泳的条带,应该在700BP和550BP出目的带,结果在最下面有很严重的拖尾,目的条带看不出来,请问各位大侠是什么原因?

你的Marker是多大的?第一个好像有点东西
看其他结果,就是没P出来。
这种情况可能会有许多原因:
(1)引物不适合,可能是引物设计时就有问题,不能扩增出目的条带,或者引物合成有问题(公司有时候会搞错的,要好好对对序列)
(2)模板的问题,模板降解或者没有成功提取出来,或者反转录的RNA降解了等
(3)反应体系的问题,反应体系中,Taq酶是非常关键的,不同PCR根据实验要求选用不同Taq酶;另外就是反应体系,各个成分的加入量,主要是模板、Taq酶和Mg离子的量的不同,这个要进行优化的。
(4)在就是反应条件了,大家一般都强调退火温度,其实还有各部反应时间,也是挺重要的,这里就不具体讲了。
祝你试验顺利,在有问题,可以联系我。
戒骄戒躁,坦荡做人,平常心做事,享受生活之美!!
11楼2011-05-21 19:12:42
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beautybanana

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-05-19 12:33:00
1949stone(金币+2): 越看越有道理 2011-05-19 12:34:16
引用回帖:
Originally posted by yanyuyu at 2011-05-19 10:05:42:
这是我电泳的条带,应该在700BP和550BP出目的带,结果在最下面有很严重的拖尾,目的条带看不出来,请问各位大侠是什么原因?

在750bp和500bp(DL2000的marker是吧)处没有目的条带,没有扩增出产物,可能是引物或是PCR程序问题,再仔细核对下~做个温度梯度,不行的话就检查下引物的特异性了~
2楼2011-05-19 11:01:25
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

1949stone(EPI+1): 来了 2011-05-19 12:31:59
marker 标记一下。
没有条带原因太多了:

1:PCR体系的问题 不知道你有没有进行温度梯度的设定呢?还有你的体系是怎么样的?
2:引物的退火温度和稀释的均匀程度也会影响PCR的效果。

重复做一次。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
3楼2011-05-19 11:55:58
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奔跑的西瓜

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-05-19 12:33:14
1949stone: 是非特异性 貌似 2011-05-19 12:33:47
貌似是降解了,你检下你的模板DNA吧,看看怎么样,或者是引物非特异性结合了
4楼2011-05-19 12:23:10
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