应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 做RT-PCR时该用哪段氨基酸序列设计引物
51/1返回列表
查看: 2295  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

DONGFANGXYZ

金虫 (小有名气)

[求助] 做RT-PCR时该用哪段氨基酸序列设计引物

我要从植物中提取一种酶，但这种酶很难纯化，而且这种酶在其他植物中也没有报道。在菌中有报道这种酶并可查到其氨基酸序列。
   现在我想根据这个菌中报道的氨基酸序列来设计引物，从我的植物中提取RNA来做RT-PCR。
   请问这个引物的设计要用哪一段氨基酸序列呢？是N端和C端吗？菌中的N端和C端氨基酸序列会和我要提取的植物中的氨基酸序列相同吗？N端和C端是保守序列吗？

第一次发贴，请求帮助！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-17 14:34:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by DONGFANGXYZ at 2011-05-17 18:50:00
我只知道这个酶菌中的氨基酸序列，不知道DNA序列，想根据菌中的氨基酸序列设计引物，从植物中提取RNA做RT-PCR后转录进大肠杆菌确定出这个酶的大小，再从植物中分离出此酶。...

我也是新手，想知道。求分享
赞一下 回复此楼
7楼2013-11-05 17:58:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

love_st

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

DONGFANGXYZ(金币+2): 谢谢你，本人底子比较差，第一次做PCR，很多地方都不懂，还请多多关照。 2011-05-17 16:16:02
N端和C端都没有关系，因为你这个植物里没有相关的基因，所以你只能把菌的相关基因进行比对，同时也可以找和这个植物物种比较接近的进行比对，然后设计简并引物
赞一下 回复此楼
2楼2011-05-17 16:00:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DONGFANGXYZ

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by love_st at 2011-05-17 16:00:58:
N端和C端都没有关系，因为你这个植物里没有相关的基因，所以你只能把菌的相关基因进行比对，同时也可以找和这个植物物种比较接近的进行比对，然后设计简并引物

“菌的相关基因比对”是菌内发现的和这个酶的氨基酸序列相似度高的序列进行比对，然后找出相同氨基酸序列，用相同的序列来设计引物么？
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-17 16:10:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love_st

金虫 (著名写手)
菌内编码你这个酶的基因进行比对找出保守的，最好多找一些相关基因，物种越近越好吧
赞一下 回复此楼
4楼2011-05-17 16:25:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C79jjtjAKjEn 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:42 by cITaGg3p5edr
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C79jjtjAKjEn 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:40 by cITaGg3p5edr
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 3/150 2026-09-18 02:54 by cITaGg3p5edr
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vZfe6xYu34yj 2026-09-15 3/150 2026-09-18 02:40 by cITaGg3p5edr
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 23:28 by cuPZTDXS3VOd
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 8/400 2026-09-17 23:28 by cuPZTDXS3VOd
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-17 23:05 by cuPZTDXS3VOd
[基金申请] 国社科系统bug了，是不是要放榜了？ +5 kynobel 2026-09-16 6/300 2026-09-17 21:37 by tosogo
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:15 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:29 by ObVzqQQh1rrE
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:17 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-17 12:39 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +8 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 8/400 2026-09-17 11:27 by UAIjTRMuUFoj
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 4/200 2026-09-17 06:26 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:04 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-17 03:52 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:35 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭