应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » pymol作图，谢谢
51/1返回列表
查看: 1652  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

PSA

专家顾问 (著名写手)

[求助] pymol作图，谢谢

请教大家，

用DS将小分子和蛋白对接后，存成mol2文件，然后期望能用pymol显示，但是小分子和蛋白不能同时出现在一个窗口里就，所以。。。

把这个mol2文件用MVD软件打开，是可以显示的


求解这是什么原因呢，再次谢谢您的帮助
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-04-27 13:47:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
PSA(金币+5): 谢谢您的帮助 2011-04-27 14:56:51
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-27 15:30:21
PSA(金币+1): 2011-04-27 21:18:20
引用回帖:
Originally posted by PSA at 2011-04-27 13:53:55:
恩，是这两种格式

但是DS不能存成PDB

用sybyl中的merge也没保存明白，所以。。。。。。

呵呵·~MVD就可以啊~输出的时候选择PDB就可以了~
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-27 14:23:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-27 15:30:03
PSA(金币+1): 2011-04-27 21:18:36
引用回帖:
Originally posted by PSA at 2011-04-27 13:47:06:
请教大家，

用DS将小分子和蛋白对接后，存成mol2文件，然后期望能用pymol显示，但是小分子和蛋白不能同时出现在一个窗口里就，所以。。。

把这个mol2文件用MVD软件打开，是可以显示的


求解这是什么原因 ...

就我所知，PYMOL是可以打开PDB和MOL2格式的，能不能试着保存成PDB格式呢？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-27 13:49:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

PSA

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2011-04-27 13:49:48:
就我所知，PYMOL是可以打开PDB和MOL2格式的，能不能试着保存成PDB格式呢？

恩，是这两种格式

但是DS不能存成PDB

用sybyl中的merge也没保存明白，所以。。。。。。
赞一下 回复此楼
3楼2011-04-27 13:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

PSA

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2011-04-27 14:23:13:
呵呵·~MVD就可以啊~输出的时候选择PDB就可以了~

MVD做的结果不好，恩好的，那我先试试
赞一下 回复此楼
5楼2011-04-27 14:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 复试调剂 +6 asdasdassda 2026-04-05 7/350 2026-04-12 00:26 by 丛麟ll
[考研] 材料工程281还有调剂机会吗 +19 xaw. 2026-04-11 19/950 2026-04-11 23:20 by labixiaoqiao
[考研] 211本科材料化工求调剂 +13 YHLAH 2026-04-11 14/700 2026-04-11 23:13 by 幸免 ..
[考研] 材料工程日语考生求调剂 +7 0856?调剂 2026-04-10 7/350 2026-04-11 21:33 by 蓝云思雨
[考研] 291分调剂 +5 上岸小莹加油 2026-04-09 6/300 2026-04-11 21:06 by 逆水乘风
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 计算机11408，286分求调剂 +10 木子念晞 2026-04-05 10/500 2026-04-11 10:44 by zhq0425
[考研] 电气工程专硕320求调剂 +4 小麻子111 2026-04-10 4/200 2026-04-11 10:19 by Delta2012
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 调剂 化学 307 +21 73372112 2026-04-09 23/1150 2026-04-10 23:53 by wj165256
[考研] 一志愿211，化学310分，本科重点双非，求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 本科郑州大学，一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 083200 初试305分 求调剂 暂不考虑跨专业 +15 Claireyyyy 2026-04-09 15/750 2026-04-09 16:11 by zhuimr
[考研] 296求调剂 +3 汪！？！ 2026-04-08 3/150 2026-04-08 22:00 by zhouyuwinner
[考研] 土木水利专硕276分求调剂 +6 我想上学！！6 2026-04-05 9/450 2026-04-08 17:45 by 宋小宝HQ
[考研] 求调剂，现在还能填的 +3 上岸小莹加油 2026-04-08 3/150 2026-04-08 14:30 by zhq0425
[考研] 372分材料与化工（085600）英二数二求调剂 +4 蓝笺片 2026-04-06 4/200 2026-04-07 12:30 by dongzh2009
[考研] 327考研调剂推荐 +6 呜呜呜呜呢 2026-04-06 6/300 2026-04-06 21:39 by 啵啵啵0119
[考研] 283求调剂 +5 baiiyu 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:35 by 啵啵啵0119
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭