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vs570588木虫 (正式写手)
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请问OTU，operational taxonomic unit是啥意思 已有2人参与
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| OTU/clones这个单位在克隆文库里的单位是啥？我做的混合培养细菌，另外，问问DGGE切胶克隆建立文库，大家是把所用条带都切，还是只切亮的条带？还有就是一个培养皿中大家一般送几个菌落去测序？按道理一个培养皿中应该是纯菌了，如果送过去多个测序结果出现不一致，如何解释？ |
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vs570588
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3楼2011-04-22 19:31:05
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【答案】应助回帖
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运算的分类单位 operational taxonomic unit 缩写OTU，指在数量分类学方面作为对象的分类单位之总称，有种、变种、个体等。在用群析的时候，根据相似系数值和由任意标准去归纳整理有可能的，因为也有与历来分类单位的等级（rank）不一致的情况，所以使用了这个术语。 OTU，是指系统发生分析中的一个外部节点，是一个假定的分类单元；常见于动植物种类系统发育分析。例如 6 clone/2 OTUs 是指要进行系统分类分析的个体，即每2个待分析的个体包含6个克隆。 这里还有篇英文文献：Defining operational taxonomic units using DNA barcode data http://www.bolinfonet.org/pdf/De ... barcodedata2005.pdf |
2楼2011-04-22 00:09:59
西瓜
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4楼2011-04-22 19:42:48
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