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heavennew铁杆木虫 (正式写手)
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[求助]
遗传进化分析OTUs
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| 最近看到很多环境微生物的文献中在做遗传分析的时候都做了OTUs,不知道为什么要做这个东西,还有稀释曲线,希望有高人指教一下,谢谢了! |
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heavennew
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3楼2012-12-21 12:58:18
【答案】应助回帖
★ ★ ★
rainwander: 金币+3, MicEPI+1, 鼓励交流 2012-12-24 19:41:10
rainwander: 金币+3, MicEPI+1, 鼓励交流 2012-12-24 19:41:10
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首先,我必须说我也是刚开始学习这方面的知识,最近在整理进化树,一棵系统进化树是由一系列节点(node)和边(branch)组成的无环连通图(connected acyclic graph)。节点用来描述分类单元(taxonomic units)(属、种群、个体等),而节点之间的连线代表物种之间的进化关系。树的节点又分为内部节点(internal node)和外部节点(terminal node)。内部节点又称为分枝点,代表进化事件发生的位置,或代表分类单元进化历程中的祖先,外部结点代表实际观察到的分类单元,又称操作单元(operational taxonomic unit,OTU)。分类单元可以是物种也可以是序列,对于分子系统发生树来说,基本上以核酸序列或蛋白质序列作为分类单元。 不知道你能不能看懂 |
8楼2012-12-24 18:25:20
heavennew
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2楼2012-12-21 12:57:40
4楼2012-12-21 17:41:32
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5楼2012-12-22 19:36:15
6楼2012-12-23 08:13:52
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7楼2012-12-24 13:42:14













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