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powerke

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[求助] 计算机模拟药物分子结构的建议

老板让我学习计算机模拟方面的书，自己设计一个药物分子。但是网上的软件一大堆，各位做过药物模拟的同学们给个建议，用哪款软件？学学习时要注意哪些方面？小弟是做合成的，仅仅就是模拟一个出来自己合成测试活性。

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1楼2011-04-21 12:24:55

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powerke

木虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by PSA at 2011-04-21 22:46:04:
模拟是最好的，活性也不一定是最好的哦

要是想简单的模拟一下可以用的docking软件如下：

MVD, SYBYL, DS，当然还有很多其它的呵呵

略知一点点的我飘过

谢谢了，头很大

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6楼2011-04-22 08:58:08

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houxuben

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★
powerke(金币+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金币+1): 谢谢交流 2011-04-22 17:23:43

建议看看徐筱杰的《计算机辅助药物设计》，还有徐文方的《药物设计学》。具体软件做QSAR建议用SYBYL，当然，SYBYL里面还有很多模块，分子对接、同源模建、动力学模拟等，不过QSAR做的算是比较好的。药效团建议用catalyst。分子对接建议用GOLD，这个是收费的，学术版的AUTODOCK也不错。动力学可以用GROMCAS。论坛里有很多介绍的。