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powerke

木虫 (小有名气)

[求助] 计算机模拟药物分子结构的建议

老板让我学习计算机模拟方面的书,自己设计一个药物分子。但是网上的软件一大堆,各位做过药物模拟的同学们给个建议,用哪款软件?学学习时要注意哪些方面?小弟是做合成的,仅仅就是模拟一个出来自己合成测试活性。
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powerke

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by gancs7894 at 2011-04-21 21:55:07:
治疗什么疾病的药物分子,确定靶点吗,有靶点的晶体结构吗

治疗癌症的,有靶点,晶体结构没有的,只要模拟一下活性,选最好的就行了
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4楼2011-04-21 22:00:37
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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

【答案】应助回帖


powerke(金币+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金币+1): 谢谢交流 2011-04-22 17:23:43
建议看看徐筱杰的《计算机辅助药物设计》,还有徐文方的《药物设计学》。具体软件做QSAR建议用SYBYL,当然,SYBYL里面还有很多模块,分子对接、同源模建、动力学模拟等,不过QSAR做的算是比较好的。药效团建议用catalyst。分子对接建议用GOLD,这个是收费的,学术版的AUTODOCK也不错。动力学可以用GROMCAS。论坛里有很多介绍的。
2楼2011-04-21 17:48:10
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gancs7894

金虫 (著名写手)

治疗什么疾病的药物分子,确定靶点吗,有靶点的晶体结构吗
3楼2011-04-21 21:55:07
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PSA

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by powerke at 2011-04-21 22:00:37:
治疗癌症的,有靶点,晶体结构没有的,只要模拟一下活性,选最好的就行了

模拟是最好的,活性也不一定是最好的哦

要是想简单的模拟一下可以用的docking软件如下:

MVD, SYBYL, DS,当然还有很多其它的呵呵

略知一点点的我飘过
5楼2011-04-21 22:46:04
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