应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 程序代码 » 计算机模拟药物分子结构的建议
131/2返回列表12下一页
查看: 1927  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

powerke

木虫 (小有名气)

[求助] 计算机模拟药物分子结构的建议

老板让我学习计算机模拟方面的书，自己设计一个药物分子。但是网上的软件一大堆，各位做过药物模拟的同学们给个建议，用哪款软件？学学习时要注意哪些方面？小弟是做合成的，仅仅就是模拟一个出来自己合成测试活性。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
坚持每天看一篇英文文献
1楼 2011-04-21 12:24:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

【答案】应助回帖

★
powerke(金币+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金币+1): 谢谢交流 2011-04-22 17:23:43
建议看看徐筱杰的《计算机辅助药物设计》，还有徐文方的《药物设计学》。具体软件做QSAR建议用SYBYL，当然，SYBYL里面还有很多模块，分子对接、同源模建、动力学模拟等，不过QSAR做的算是比较好的。药效团建议用catalyst。分子对接建议用GOLD，这个是收费的，学术版的AUTODOCK也不错。动力学可以用GROMCAS。论坛里有很多介绍的。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-21 17:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gancs7894

金虫 (著名写手)
治疗什么疾病的药物分子，确定靶点吗，有靶点的晶体结构吗
赞一下 回复此楼
3楼2011-04-21 21:55:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

powerke

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by gancs7894 at 2011-04-21 21:55:07:
治疗什么疾病的药物分子，确定靶点吗，有靶点的晶体结构吗

治疗癌症的，有靶点，晶体结构没有的，只要模拟一下活性，选最好的就行了
赞一下 回复此楼
坚持每天看一篇英文文献
4楼2011-04-21 22:00:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

PSA

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by powerke at 2011-04-21 22:00:37:
治疗癌症的，有靶点，晶体结构没有的，只要模拟一下活性，选最好的就行了

模拟是最好的，活性也不一定是最好的哦

要是想简单的模拟一下可以用的docking软件如下：

MVD, SYBYL, DS，当然还有很多其它的呵呵

略知一点点的我飘过
赞一下 回复此楼
5楼2011-04-21 22:46:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

powerke

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by PSA at 2011-04-21 22:46:04:
模拟是最好的，活性也不一定是最好的哦

要是想简单的模拟一下可以用的docking软件如下：

MVD, SYBYL, DS，当然还有很多其它的呵呵

略知一点点的我飘过

谢谢了，头很大
回复此楼
坚持每天看一篇英文文献
6楼2011-04-22 08:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lasteye

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

powerke(金币+5): 2011-04-22 13:43:24
靶点结构未知，恐怕要同源建模啊。能具体说说是哪个靶点吗？或许我可以帮你。
赞一下 回复此楼
愿为“中国创造”倾尽绵薄之力。
7楼2011-04-22 12:35:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

powerke

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lasteye at 2011-04-22 12:35:48:
靶点结构未知，恐怕要同源建模啊。能具体说说是哪个靶点吗？或许我可以帮你。

是EGFR抑制剂，找个已报道的结构，修改一下基团，测试活性。
赞一下 回复此楼
坚持每天看一篇英文文献
8楼2011-04-22 12:49:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lasteye

金虫 (小有名气)
EGFR的激酶结构域的晶体结构有报道啊，pdb数据库里可以查到，而且还有大量已知的小分子抑制剂可以参考，要设计一个新的活性分子并不难
赞一下 回复此楼
愿为“中国创造”倾尽绵薄之力。
9楼2011-04-22 13:20:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

powerke

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lasteye at 2011-04-22 13:20:23:
EGFR的激酶结构域的晶体结构有报道啊，pdb数据库里可以查到，而且还有大量已知的小分子抑制剂可以参考，要设计一个新的活性分子并不难

导师让我先用软件模拟一下，找个活性最好的，直接合成。这样可以少走些弯路吧
赞一下 回复此楼
坚持每天看一篇英文文献
10楼2011-04-22 13:23:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 powerke 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[基金申请] 面上和青基一样限30页不合理 +5 wowsunflower 2026-03-10 7/350 2026-03-14 17:21 by kingkocxr
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧， 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 环境调剂 +6 晓看天暮看云 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:16 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:30 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分，求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[硕博家园] 木虫好像不热闹了，是不是？ +4 偏振片 2026-03-10 4/200 2026-03-10 09:51 by longwave
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭