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powerke

木虫 (小有名气)

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[求助] 计算机模拟药物分子结构的建议

老板让我学习计算机模拟方面的书，自己设计一个药物分子。但是网上的软件一大堆，各位做过药物模拟的同学们给个建议，用哪款软件？学学习时要注意哪些方面？小弟是做合成的，仅仅就是模拟一个出来自己合成测试活性。

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坚持每天看一篇英文文献

1楼 2011-04-21 12:24:55

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gao1zheng

新虫 (小有名气)

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引用回帖:

9楼: Originally posted by lasteye at 2011-04-22 13:20:23
EGFR的激酶结构域的晶体结构有报道啊，pdb数据库里可以查到，而且还有大量已知的小分子抑制剂可以参考，要设计一个新的活性分子并不难

您好，想请教您一个靶点蛋白的药物设计的问题，不知是否有机会和您聊聊

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13楼2022-09-13 10:29:21

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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

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【答案】应助回帖

★
powerke(金币+5): 2011-04-22 13:43:10
ben_ladeng(金币+1): 谢谢交流 2011-04-22 17:23:43

建议看看徐筱杰的《计算机辅助药物设计》，还有徐文方的《药物设计学》。具体软件做QSAR建议用SYBYL，当然，SYBYL里面还有很多模块，分子对接、同源模建、动力学模拟等，不过QSAR做的算是比较好的。药效团建议用catalyst。分子对接建议用GOLD，这个是收费的，学术版的AUTODOCK也不错。动力学可以用GROMCAS。论坛里有很多介绍的。

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2楼2011-04-21 17:48:10

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