| 查看: 845 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
mdp参数设置
|
||
|
; User spoel (236) ; Wed Nov 3 17:12:44 1993 ; Input file ; title = Yo cpp = /lib/cpp define = -DFLEX_SPC constraints = all-bonds integrator = md dt = 0.002 ; ps ! nsteps = 10000 ; total 20 ps. nstcomm = 1 nstxout = 500 nstvout = 1000 nstfout = 0 nstlog = 500 nstenergy = 500 nstlist = 5 ns_type = grid coulombtype = PME rlist = 1.0 rcoulomb = 1.0 rvdw = 1.4 fourierspacing = 0.12 pme_order = 4 optimize_fft = yes ; Berendsen temperature coupling is on in two groups Tcoupl = berendsen tc-grps = Protein_UNK POP SOL_CL tau_t = 0.1 0.1 0.1 ref_t = 0 0 50 ; Energy monitoring energygrps = POPC SOL ; Pressure coupling is not on Pcoupl = berendsen pcoupltype = anisotropic tau_p = 1 compressibility = 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 0 0 0 ref_p = 1 1 1 1 1 1 ; Generate velocites is on at 323 K. gen_vel = no gen_temp = 300.0 gen_seed = 173529 请问一下在对体系升温的时候要写Pcoupl 吗，升温是不是就是手册上的NVT过程啊，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
球磨粉体时遇到了大的问题，请指教！
已经有8人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有14人回复
-
江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后
已经有3人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- castep 几何优化中的参数设置
已经有4人回复
- 结构优化参数设置
已经有6人回复
- 求助PCR反应参数设置
已经有9人回复
- 【求助】MS计算中能带 参数设置
已经有11人回复
- 【求助】【请教】计时电位法参数设置
已经有5人回复
- 【求助】CASTEP中的参数设置问题
已经有9人回复
- 【求助】高手快来指点指点啊，计算时方法参数设置问题
已经有5人回复
- 测试EIS时的一个参数设置（什么电压）
已经有3人回复
- 【求助】vasp参数设置
已经有5人回复
- 【求助】交流阻抗测试参数设置
已经有8人回复
- 【求助】求助，急！电化学工作站 恒电位 恒电流参数设置问题！！
已经有38人回复
- 【求助】ENVI中SVM监督分类参数设置
已经有9人回复
whl2dxl
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2115.6
- 红花: 3
- 帖子: 151
- 在线: 115小时
- 虫号: 1267846
- 注册: 2011-04-17
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2011-04-23 00:47:46
2楼2011-04-21 14:12:55
whl2dxl
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2115.6
- 红花: 3
- 帖子: 151
- 在线: 115小时
- 虫号: 1267846
- 注册: 2011-04-17
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-04-23 00:51:02