| 查看: 903 | 回复: 3 | |||
[求助]
mdp参数设置
|
|
; User spoel (236) ; Wed Nov 3 17:12:44 1993 ; Input file ; title = Yo cpp = /lib/cpp define = -DFLEX_SPC constraints = all-bonds integrator = md dt = 0.002 ; ps ! nsteps = 10000 ; total 20 ps. nstcomm = 1 nstxout = 500 nstvout = 1000 nstfout = 0 nstlog = 500 nstenergy = 500 nstlist = 5 ns_type = grid coulombtype = PME rlist = 1.0 rcoulomb = 1.0 rvdw = 1.4 fourierspacing = 0.12 pme_order = 4 optimize_fft = yes ; Berendsen temperature coupling is on in two groups Tcoupl = berendsen tc-grps = Protein_UNK POP SOL_CL tau_t = 0.1 0.1 0.1 ref_t = 0 0 50 ; Energy monitoring energygrps = POPC SOL ; Pressure coupling is not on Pcoupl = berendsen pcoupltype = anisotropic tau_p = 1 compressibility = 4.5e-5 4.5e-5 4.5e-5 0 0 0 ref_p = 1 1 1 1 1 1 ; Generate velocites is on at 323 K. gen_vel = no gen_temp = 300.0 gen_seed = 173529 请问一下在对体系升温的时候要写Pcoupl 吗，升温是不是就是手册上的NVT过程啊，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
3,4-二羟基苯乙酮如何纯化？
已经有6人回复
-
一篇MDPI论文改变了学习工作和生活
已经有4人回复
-
一个化合物的合成路线：CAS:367929-02-0 名称：8β-乙烯基雌二醇
已经有4人回复
-
太白金星有点烦
已经有3人回复
-
中国地质大学（北京）博士招生补录，数理学院材料科学与工程专业和材料与化工专业
已经有3人回复
-
河北省自然基金
已经有8人回复
-
收到国自然专家邀请后几年才会有本子送过来评
已经有3人回复
-
考博
已经有3人回复
-
有没有快的中文核心比较快录用的，纳米材料光催化
已经有4人回复
-
本人42，博士刚毕业，现在找不到工作，怎么办？:(
已经有21人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- castep 几何优化中的参数设置
已经有4人回复
- 结构优化参数设置
已经有6人回复
- 求助PCR反应参数设置
已经有9人回复
- 【求助】MS计算中能带 参数设置
已经有11人回复
- 【求助】【请教】计时电位法参数设置
已经有5人回复
- 【求助】CASTEP中的参数设置问题
已经有9人回复
- 【求助】高手快来指点指点啊，计算时方法参数设置问题
已经有5人回复
- 测试EIS时的一个参数设置（什么电压）
已经有3人回复
- 【求助】vasp参数设置
已经有5人回复
- 【求助】交流阻抗测试参数设置
已经有8人回复
- 【求助】求助，急！电化学工作站 恒电位 恒电流参数设置问题！！
已经有38人回复
- 【求助】ENVI中SVM监督分类参数设置
已经有9人回复
2楼2011-04-21 14:12:55
whl2dxl
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2115.6
- 红花: 3
- 帖子: 151
- 在线: 115小时
- 虫号: 1267846
- 注册: 2011-04-17
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2011-04-23 00:47:46
whl2dxl
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2115.6
- 红花: 3
- 帖子: 151
- 在线: 115小时
- 虫号: 1267846
- 注册: 2011-04-17
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-04-23 00:51:02