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noeyedragon金虫 (正式写手)
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【求助】高手快来指点指点啊，计算时方法参数设置问题 已有3人参与
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在ChemOffice2008中，计算功能calculation，GAMESS Interface>MINIMize(Energy\Geomitry)>Job type=Optimize to Transition State,此时当要算的物质位何种结构时选HF,MP2,DFT...就是说什么情况下用相应的什么样的算法，一个算法确定下来后，根据什么来选择基组也就是说在什么情况下选择对应的基组？还有波函数是开壳闭壳怎么选？哪个极化和H怎么选定？Diffuse怎么选？EXPONENT如何确定？高手快来扫盲啊，^_^ |
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noeyedragon
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2楼2010-06-25 13:52:07
noeyedragon
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密度泛函理论的基本参量是电子密度, 所有交换相关泛函可以用电子密度来展开, 零级近似就是交换相关泛函仅仅是电子局域密度的函数. 因为在分子体系中, 电子密度在各个空间点是不同的, 我们认为在小区域中电子密度是常数值, 就是一种近似, 零级近似. 这种局域密度近似计算出来的键长都比实验值短, 因此为了改进它, 交换相关泛函不仅是局域密度的函数, 还是局域密度电子空间变化趋势, 即密度梯度的函数, 这样, 分子结构的计算就被改进了. 由于不存在系统的方法逼近精确泛函, 现在存在不同形式的泛函, 适用于不同的体系. 常用的有B3LYP, 它属于杂化泛函. 另外还有BLYP, PBE等. 精度： DFT ~ (HF+MP2) 大多数情况下! 可靠性：DFT: 需要把结果与实验值（如几何结构）对照，先验证泛函的合理性和适用性，再进行进一步预测其它性质 （HF+MP2)：大多数情况下结果都可靠，甚至可以推倒实验的解释结果 计算量：DFT << (HF+MP2) 弱作用：主要还是用从头算 极化函数: 考虑到原子在分子中的各向异性，添加各向异性高的极化轨道，d或f轨道，比如6－31G(d, p)等。 弥散函数: 考虑到分子中原子之间的远程相互作用，添加弥散函数。其指数中z很小( ~0.1)，因此r = n/z(>5A)就很大，扩展的范围很大，比如6－31＋＋G。 初步寻找分子结构用小基组, 再用大基组进一步计算 一般必须包含极化基组 有氢键或大p键应该包含弥散基组 可以对中心及其附近使用精度高的基组，而外围用精度低的基组以降低计算量 下面是几个选取基组的原则: 1. 先用小基组进行计算, 特别是寻找分子结构的极小点, 再用大基组再次寻找. 2.一般我们都要把极化基组包括进去, 这相当于中等基组. 3.有氢键或大π键或共轭相互作用要包含弥散基组 4. 为了简化计算, 可以对中心采用精度高的基组, 对外围采用小基组. |
3楼2010-06-25 13:52:49
snoopyzhao
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