| 查看: 1397 | 回复: 5 | ||||
noeyedragon金虫 (正式写手)
|
[交流]
【求助】高手快来指点指点啊，计算时方法参数设置问题 已有3人参与
|
在ChemOffice2008中，计算功能calculation，GAMESS Interface>MINIMize(Energy\Geomitry)>Job type=Optimize to Transition State,此时当要算的物质位何种结构时选HF,MP2,DFT...就是说什么情况下用相应的什么样的算法，一个算法确定下来后，根据什么来选择基组也就是说在什么情况下选择对应的基组？还有波函数是开壳闭壳怎么选？哪个极化和H怎么选定？Diffuse怎么选？EXPONENT如何确定？高手快来扫盲啊，^_^ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Flow chemistry |
» 猜你喜欢
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有1人回复
-
能源环境新材料研究团队 研究生调剂招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有59人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
齐齐哈尔大学材料科学与工程学院有调剂名额
已经有0人回复
-
苏州科技大学 物理学专业 接收调剂生
已经有0人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
苏州科技大学 物理学专业 接收调剂生
已经有0人回复
-
苏州科技大学 物理学专业 接收调剂生
已经有0人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教关于本机的Dmol计算问题——望高手指点
已经有6人回复
- MS discover 计算出错，请高手指点一下
已经有4人回复
- 请高手指点NBS溴化苄基问题
已经有16人回复
- 静电纺丝时，针头容易堵塞，求高手指点是否也碰到过这样的问题？
已经有28人回复
- 【求助】请CAD高手指点----关于CAD设置问题
已经有4人回复
- Western blot中出现的问题-求高手指点
已经有17人回复
- VASP计算时的几个细节设置问题，希望有经验的人过来指点一下！
已经有23人回复
- 【求助】高手指点，边界条件设置
已经有6人回复
- 【求助】MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？请高手指点
已经有28人回复
- 【求助】请高手指点diamond画图里的断键（broken off bond）设置
已经有9人回复
- 关于电脑配置，请电脑高手指点
已经有40人回复
- NCBI blast 结果一些参数的含义求高手指点
已经有12人回复
noeyedragon
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3343.7
- 散金: 6
- 帖子: 760
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 1002404
- 注册: 2010-04-21
- 专业: 合成药物化学
2楼2010-06-25 13:52:07
noeyedragon
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3343.7
- 散金: 6
- 帖子: 760
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 1002404
- 注册: 2010-04-21
- 专业: 合成药物化学
|
密度泛函理论的基本参量是电子密度, 所有交换相关泛函可以用电子密度来展开, 零级近似就是交换相关泛函仅仅是电子局域密度的函数. 因为在分子体系中, 电子密度在各个空间点是不同的, 我们认为在小区域中电子密度是常数值, 就是一种近似, 零级近似. 这种局域密度近似计算出来的键长都比实验值短, 因此为了改进它, 交换相关泛函不仅是局域密度的函数, 还是局域密度电子空间变化趋势, 即密度梯度的函数, 这样, 分子结构的计算就被改进了. 由于不存在系统的方法逼近精确泛函, 现在存在不同形式的泛函, 适用于不同的体系. 常用的有B3LYP, 它属于杂化泛函. 另外还有BLYP, PBE等. 精度： DFT ~ (HF+MP2) 大多数情况下! 可靠性：DFT: 需要把结果与实验值（如几何结构）对照，先验证泛函的合理性和适用性，再进行进一步预测其它性质 （HF+MP2)：大多数情况下结果都可靠，甚至可以推倒实验的解释结果 计算量：DFT << (HF+MP2) 弱作用：主要还是用从头算 极化函数: 考虑到原子在分子中的各向异性，添加各向异性高的极化轨道，d或f轨道，比如6－31G(d, p)等。 弥散函数: 考虑到分子中原子之间的远程相互作用，添加弥散函数。其指数中z很小( ~0.1)，因此r = n/z(>5A)就很大，扩展的范围很大，比如6－31＋＋G。 初步寻找分子结构用小基组, 再用大基组进一步计算 一般必须包含极化基组 有氢键或大p键应该包含弥散基组 可以对中心及其附近使用精度高的基组，而外围用精度低的基组以降低计算量 下面是几个选取基组的原则: 1. 先用小基组进行计算, 特别是寻找分子结构的极小点, 再用大基组再次寻找. 2.一般我们都要把极化基组包括进去, 这相当于中等基组. 3.有氢键或大π键或共轭相互作用要包含弥散基组 4. 为了简化计算, 可以对中心采用精度高的基组, 对外围采用小基组. |
3楼2010-06-25 13:52:49
snoopyzhao
至尊木虫 (职业作家)
- QC强帖: 1
- 应助: 157 (高中生)
- 贵宾: 0.02
- 金币: 18844.7
- 红花: 29
- 帖子: 3803
- 在线: 1422.4小时
- 虫号: 183750
- 注册: 2006-02-13
- 专业: 污染生态化学
4楼2010-06-25 15:30:37
noeyedragon
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3343.7
- 散金: 6
- 帖子: 760
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 1002404
- 注册: 2010-04-21
- 专业: 合成药物化学
5楼2010-06-25 15:33:08
sunhaitao
木虫 (小有名气)
- QC强帖: 1
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 3138.4
- 散金: 11
- 红花: 2
- 帖子: 281
- 在线: 416.9小时
- 虫号: 718371
- 注册: 2009-03-09
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2010-06-28 22:55:42
120