应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » siesta计算弱相互作用VDW
181/2返回列表12下一页
查看: 4008  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

hw45888792

金虫 (正式写手)

[求助] siesta计算弱相互作用VDW

siesta trunk版本可以计算两个体系之间的弱相互作用VDW，泛函为

XC.functional VDW
XC.authors DRSLL

    不知道有人用过没？我测试发现，好像需要自己重新做赝势？

read_vps: Pseudopotential generation method:
read_vps: ATM3      Troullier-Martins
Total valence charge:    1.00000

xc_check: Exchange-correlation functional:
xc_check: VDW Dion-Rydberg-Schroeder-Langreth-Lundqvist
xc_check: WARNING: Pseudopotential generated with Ceperley-Alder functional
V l=0 = -2*Zval/r beyond r=  1.2343
V l=1 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
V l=2 = -2*Zval/r beyond r=  1.2189
All V_l potentials equal beyond r=  1.2343
This should be close to max(r_c) in ps generation
All pots = -2*Zval/r beyond r=  1.2343

VLOCAL1: 99.0% of the norm of Vloc inside     28.493 Ry
VLOCAL1: 99.9% of the norm of Vloc inside     64.935 Ry
atom: Maximum radius for 4*pi*r*r*local-pseudopot. charge    1.45251
atom: Maximum radius for r*vlocal+2*Zval:    1.21892
GHOST: No ghost state for L =  0
GHOST: WARNING: Ghost state for L =  1
GHOST: No ghost state for L =  2
KBgen: WARNING: Ghost states have been detected
KBgen: WARNING: Some parameter should be changed in the
KBgen: WARNING: pseudopotential generation procedure.
Stopping Program from Node:    0
p0_20173:  p4_error: : 1

[ Last edited by hw45888792 on 2011-4-20 at 15:03 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯理论相关知识 atk&transiesta

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
宠辱不惊，看庭前花开花落；去留无意，望天空云卷云舒。
1楼 2011-04-20 15:02:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-20 21:39:21
hw45888792(金币+10): 2011-05-05 21:45:05
引用回帖:
Originally posted by hw45888792 at 2011-04-20 08:02:38:
siesta trunk版本可以计算两个体系之间的弱相互作用VDW，泛函为

XC.functional VDW
XC.authors DRSLL

    不知道有人用过没？我测试发现，好像需要自己重新做赝势？

read_vps: Pseudopotential generat ...

杨老师的学生胡伟师兄？
我对这个问题不在行。但是好像我听说过一点。
如果是需要改变参数的话，那么你去这个版本的软件包内的atom中看一下，应该这个版本中的atom能够产生VDW的赝势。
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2011-04-20 16:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-04-20 16:53:30:
杨老师的学生胡伟师兄？
我对这个问题不在行。但是好像我听说过一点。
如果是需要改变参数的话，那么你去这个版本的软件包内的atom中看一下，应该这个版本中的atom能够产生VDW的赝势。

恩，我是胡伟，你是？

这个泛函好像不能计算单个水分子，两个水分子就没有问题了，静态计算VDW比PBE总能还要低~

但是优化起来，收敛性好差，不知道是否还需要设置些什么，我也是第一个玩这个，本来打算用VASP做，但是体系有点大，两三百原子，太慢了~

siesta-L里面有人讨论过这个问题，可惜我一直打不开，不爽~
赞一下 回复此楼
宠辱不惊，看庭前花开花落；去留无意，望天空云卷云舒。
3楼2011-04-20 21:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-04-20 21:39:31
引用回帖:
Originally posted by hw45888792 at 2011-04-20 14:24:31:
恩，我是胡伟，你是？

这个泛函好像不能计算单个水分子，两个水分子就没有问题了，静态计算VDW比PBE总能还要低~

但是优化起来，收敛性好差，不知道是否还需要设置些什么，我也是第一个玩这个，本来打算用 ...

我是胡伟的师弟。你如果打不开那个网站，可以搜到了之后，然后用网页代理打开。这个方法准灵。http://www.7daili.com/
我就是这样对付SIESTA-L的以前的邮件的。
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
4楼2011-04-20 21:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)
内容已删除
回复此楼
宠辱不惊，看庭前花开花落；去留无意，望天空云卷云舒。
5楼2011-04-20 21:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)
内容已删除
回复此楼
宠辱不惊，看庭前花开花落；去留无意，望天空云卷云舒。
6楼2011-04-22 15:40:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by hw45888792 at 2011-04-22 08:40:59:
这个方法不错，可以看看以前的邮件，帮助不小。
这个泛函只有设置泛函和重做赝势就可以了，其实赝势都不需要重做，改改GGA的名称即可，反正可以优化~

有用就好
回复此楼
弘德明志博学笃行
7楼2011-04-22 20:32:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tongji888

禁虫 (小有名气)
★
zsl_321123(金币+1): 感谢交流 2011-04-29 14:13:00
本帖内容被屏蔽
8楼2011-04-27 19:10:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hw45888792

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tongji888 at 2011-04-27 19:10:49:
楼主可以试试用石墨结构来验证VDW泛函的合理性！与GGA的结果对比，不过是需要重新产生原子赝势的，方法就是强人zhangguangping说的那样。。。呵呵，我也是新手了，正好也在用这个软件，以后还希望多多交流，指导！

你产生赝势没？过程贴出来看看，效果怎么样？
赞一下 回复此楼
宠辱不惊，看庭前花开花落；去留无意，望天空云卷云舒。
9楼2011-05-05 21:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tongji888

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★
franch(金币+3): 鼓励交流 2011-05-31 09:40:44
本帖内容被屏蔽
10楼2011-05-07 12:58:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hw45888792 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 72/3600 2026-08-16 13:15 by 医学老男孩
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭