24小时热门版块排行榜    

查看: 1138  |  回复: 3

88thunder

新虫 (正式写手)

天才流浪

[交流] 如何给配位在Cd上的水加氢 已有1人参与

我用ENVI命令加氢找不到合理的Q峰,只能过理论加氢的方法来给H2O中的氧加氢了。但是我不知道如何处理?用别人说的HADD 9 03试了下,结果没有加上,请高手指导!
5555

[ Last edited by 88thunder on 2011-4-20 at 12:40 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

天才在流浪,流浪是天涯。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ylhttzj

至尊木虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
afix (将指定的原子坐标强制性的固定在指定的位置上,或者在指定的位置上产生原子)
    afix 3 表示固定H原子的坐标
    afix 13 表示固定垂直于某个平面的H原子的坐标
    afix 23 表示固定亚甲基上的H原子的坐标
    afix 137 表示固定甲基上的H原子的坐标(好像是afix 33)
    afix 43 表示固定类似于苯环上的H原子的坐标
  dfix (限定两个指定原子间的距离)
  hfix (限制氢原子在固定的位置上,如hfix 43 N6)
试一下吧!
2楼2011-04-20 13:08:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

88thunder

新虫 (正式写手)

天才流浪

引用回帖:
Originally posted by ylhttzj at 2011-04-20 13:08:06:
afix (将指定的原子坐标强制性的固定在指定的位置上,或者在指定的位置上产生原子)
    afix 3 表示固定H原子的坐标
    afix 13 表示固定垂直于某个平面的H原子的坐标
    afix 23 表示固定亚甲基上的H原 ...

新手,不懂,有没有类似的教程哦,我指给类似于H2O分子等加氢的教程,谢谢
天才在流浪,流浪是天涯。
3楼2011-04-20 14:44:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ylhttzj

至尊木虫 (知名作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
借鉴一下游离水的理论加氢。
晶体解析过程中有关游离水的理论加氢
最好通过Q值来定
Wingx程序包里面有CALC OH可以计算H2O和OH的理论位置 也是根据合适的氢键计算出来的 可以调键长等 如果真的合适就很好计算 而且出来的也很漂亮
可以先计算出来理论位置 然后再对这些氢的位置 进行refine
计算产生hatoms.out 文件
该文件里面包含H原子的信息
只要把这些相应的原则拷贝到res文件中对应的位置去
如果你想要把它们一直固定 然后不要refine了 可以这样
O1 4 0.XXXXX  0.XXXXX  0.XXXXX 11.00  0.05xxxx
afix 3
H1a   2    0.XXXXX  0.XXXXX  0.XXXXX 11.00  -1.5000
H1b   2    0.XXXXX  0.XXXXX  0.XXXXX 11.00  -1.5000
afix 0
##O1原子是先存在的 后面的H1a H1b是计算产生的
将最后的H热参数该为-1.5000
加入afix 3
afix 0 将H固定到O上
4楼2011-04-20 18:27:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 88thunder 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 yaCh4X3wd045 2026-09-14 3/150 2026-09-16 20:39 by MHf40yA0Uhyb
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 9/450 2026-09-16 18:36 by rRvxEj3zorCy
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-16 18:00 by i3KBRD19ERkG
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-16 17:15 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-16 16:51 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-16 16:15 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-16 15:51 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-16 07:48 by i0IGWqQuchto
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-16 07:12 by LH5NkK5Ud4bh
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-16 07:03 by LH5NkK5Ud4bh
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-16 06:27 by LH5NkK5Ud4bh
[找工作] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-16 02:38 by DgNGHc3h5tPl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-16 02:23 by DgNGHc3h5tPl
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 3/150 2026-09-15 19:35 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:39 by CgyNCDVNhGVg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:58 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:22 by VMDqgnlKimtZ
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
信息提示
请填处理意见