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88thunder新虫 (正式写手)
天才流浪
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如何给配位在Cd上的水加氢 已有1人参与
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我用ENVI命令加氢找不到合理的Q峰，只能过理论加氢的方法来给H2O中的氧加氢了。但是我不知道如何处理？用别人说的HADD 9 03试了下，结果没有加上，请高手指导！ 5555 [ Last edited by 88thunder on 2011-4-20 at 12:40 ] |
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借鉴一下游离水的理论加氢。 晶体解析过程中有关游离水的理论加氢 最好通过Q值来定 Wingx程序包里面有CALC OH可以计算H2O和OH的理论位置 也是根据合适的氢键计算出来的 可以调键长等 如果真的合适就很好计算 而且出来的也很漂亮 可以先计算出来理论位置 然后再对这些氢的位置 进行refine 计算产生hatoms.out 文件 该文件里面包含H原子的信息 只要把这些相应的原则拷贝到res文件中对应的位置去 如果你想要把它们一直固定 然后不要refine了 可以这样 O1 4 0.XXXXX 0.XXXXX 0.XXXXX 11.00 0.05xxxx afix 3 H1a 2 0.XXXXX 0.XXXXX 0.XXXXX 11.00 -1.5000 H1b 2 0.XXXXX 0.XXXXX 0.XXXXX 11.00 -1.5000 afix 0 ##O1原子是先存在的 后面的H1a H1b是计算产生的 将最后的H热参数该为-1.5000 加入afix 3 afix 0 将H固定到O上 |
4楼2011-04-20 18:27:48
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