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tangchaoxi

新虫 (小有名气)


[交流] 【求助】蛋白提取

请问下酸会影响提细菌蛋白吗?因为我需要将培养基中的难溶磷用酸溶掉才能得到菌体。谢谢。另外,提出的蛋白可以直接双向电泳吗?
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HarveyWang

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tangchaoxi(金币+2): 2011-05-25 09:50:40
引用回帖:
Originally posted by tangchaoxi at 2011-04-13 20:47:54:
不得不说你真的很厉害,分析的很详细!谢谢!现在问题是我找差异蛋白应该是提菌体蛋白,好像是将菌液离心,去上清,再用缓冲液重悬,然后直接硫酸铵沉淀蛋白,这过程中哪儿能去掉磷酸钙呢?还有,我那个菌产酸, ...

1)既然是找菌体差异蛋白,那应该是全菌体蛋白。 怎么是用硫酸铵来沉淀菌体蛋白呢?

全菌体蛋白的提取就是用 2D电泳的 Loading buffer (里面主要的是尿素或硫脲,还有些非离子表面活性剂等等。。这要看你的优化条件)。

你分离出细胞就可以了。不需要硫酸铵沉淀蛋白,再说硫酸铵沉淀蛋白不可能时完全的,对于你找群体差异蛋白造成很大干扰。

按照你的情况,发酵液离心得到磷酸钙和菌体沉淀,然后用缓冲液重悬,再离心沉淀,然后就加蛋白提取液 。(2D电泳膜蛋白提取 好像也有试剂盒的,比较贵些。。。你也可以选择最近的文献中 全细胞提取 尤其是膜蛋白提取的配方)


2)菌体产酸 对全菌体蛋白提取过程不会有什么影响。

因为你要发酵液离心(1 mL 发酵液足够了),然后用4℃  0.9% NaCl 洗涤一下,再离心,直接加 全菌体蛋白提取液。

离心机最好选用高速的。例如 10000 rpm--30 sec 就基本可以离心下菌体细胞了。这个洗涤过程操作也就1-2min时间。
7楼2011-04-14 07:34:12
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HarveyWang

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★ ★
amisking(金币+2, EPI+1): 鼓励发帖交流。 2011-04-12 21:45:46
tangchaoxi(金币+3): 2011-04-13 08:45:56
引用回帖:
Originally posted by tangchaoxi at 2011-04-12 11:18:00:
请问下酸会影响提细菌蛋白吗?因为我需要将培养基中的难溶磷用酸溶掉才能得到菌体。谢谢。另外,提出的蛋白可以直接双向电泳吗?

后面看到,你的蛋白是用来做双向电泳的,而不是测活的。
因此,低pH的酸应该影响不到蛋白吧。 关键是你加酸量有多少?
难道要加100 mM的HCl处理 一小时?
那菌体估计都要破掉了。


你的菌体的获得很麻烦吗?难道是生长在磷酸钙之类的上面?


菌体提取的蛋白,要分成几类:
1)最简单的,可溶性上清中的蛋白: 去除盐类后,可以做双向电泳的样品。

2)膜蛋白,因为可溶性差,需要特殊的试剂处理,增加其在第一维电泳时的可溶性。具体的你得去查论文,这里只是提示一下。

另外,实际上,对于全细胞蛋白,双向电泳许多时候会过滤掉很多蛋白点的!
选择双向电泳Loading buffer 组分很关键。
2楼2011-04-12 17:41:10
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tangchaoxi

新虫 (小有名气)


谢谢!培养基中是有磷酸钙,我就是要加酸把它给溶了,时间不长,溶了之后立即离心,用缓冲液洗洗可以吗?我是想提蛋白,双向电泳找差异蛋白。直接上双向找可以吗?
3楼2011-04-13 08:50:37
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tangchaoxi

新虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by HarveyWang at 2011-04-12 17:41:10:
后面看到,你的蛋白是用来做双向电泳的,而不是测活的。
因此,低pH的酸应该影响不到蛋白吧。 关键是你加酸量有多少?
难道要加100 mM的HCl处理 一小时?
那菌体估计都要破掉了。


你的菌体的获得很麻烦 ...

我直接用浓盐酸溶,可以吗
4楼2011-04-13 09:00:21
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