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【求助】请教怎样加氢？
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我的晶体基本已经解好了。就是想在O10上加上一个H变成桥羟基。 我看到那个解晶体的老师好像先Edit ins/res 然后再XL等 求具体怎样操作？怎样变成ＴＥＸ？怎样修改ＣＩＦ等？ 在下这此先行谢过了。 |
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 晶体 |
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梨花问雪(金币+1): 谢谢应帖。 2011-04-12 12:10:19
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afix （将指定的原子坐标强制性的固定在指定的位置上，或者在指定的位置上产生原子） afix 3 表示固定H原子的坐标 afix 13 表示固定垂直于某个平面的H原子的坐标 afix 23 表示固定亚甲基上的H原子的坐标 afix 137 表示固定甲基上的H原子的坐标（好像是afix 33） afix 43 表示固定类似于苯环上的H原子的坐标 dfix （限定两个指定原子间的距离） hfix （限制氢原子在固定的位置上，如hfix 43 N6） 在原子的数字信息部分查找是否有H原子的产生（即付利叶计算出来的H原子），如果有则要把它固定起来（afix 2 表示固定温度因子，精修坐标；afix 3表示固定坐标，精修温度因子），以防在精修时其随处飘动，引起漂移值不稳定等。 保存后退出。 继续用xl精修，看是否符合标准（也可以省略此步，因为H原子还没有加完） |
2楼2011-04-10 17:20:12
3楼2011-04-10 17:24:19
4楼2011-04-10 17:44:49
5楼2011-04-12 12:09:45
6楼2011-04-12 13:18:28