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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】引物设计软件
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7788945

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物设计软件 已有4人参与

有关引物设计软件，pp5，Oligo7，还有linux下一个引物设计软件名字没记住，发现这三个软件设计出的软件结果差别太大了，在Oligo下评分较高的引物在PP5里品分很低，发卡二聚体错配都能发现，大家都用什么软件去设计？网上对Oligo的评价很高，但是我发掘不出它的潜力啊，求高人知道下
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1楼 2011-03-30 16:20:32
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7788945

银虫 (小有名气)
★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-03-30 19:32:33
引用回帖:
Originally posted by love_st at 2011-03-30 16:35:07:
oligo还是好点，功能较强

功能是强大，但是显着有点乱，很多详细参数没默认显示出来，还有一点可能是我没操作对，就是它搜索出一对引物我按着这个序列去primer里找发现不在那个位置，比如今天找一个在Oligo里是在199那里，到primer里却是第79个碱基
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3楼2011-03-30 16:53:30
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love_st

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
oligo还是好点，功能较强
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2楼2011-03-30 16:35:07
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65900931

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我喜欢用NCBI的primer-blast，很方便。设计完再用oligo看看是否通过。
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4楼2011-03-30 18:21:08
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love_st

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 7788945 at 2011-03-30 16:53:30:
功能是强大，但是显着有点乱，很多详细参数没默认显示出来，还有一点可能是我没操作对，就是它搜索出一对引物我按着这个序列去primer里找发现不在那个位置，比如今天找一个在Oligo里是在199那里，到primer里却是 ...

位置，一个是算起始，一个是算终点，所以有差别，习惯了就很好
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5楼2011-03-31 17:24:19
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