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7788945

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物设计软件 已有4人参与

有关引物设计软件,pp5,Oligo7,还有linux下一个引物设计软件名字没记住,发现这三个软件设计出的软件结果差别太大了,在Oligo下评分较高的引物在PP5里品分很低,发卡二聚体错配都能发现,大家都用什么软件去设计?网上对Oligo的评价很高,但是我发掘不出它的潜力啊,求高人知道下
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love_st

金虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
oligo还是好点,功能较强
2楼2011-03-30 16:35:07
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7788945

银虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-03-30 19:32:33
引用回帖:
Originally posted by love_st at 2011-03-30 16:35:07:
oligo还是好点,功能较强

功能是强大,但是显着有点乱,很多详细参数没默认显示出来,还有一点可能是我没操作对,就是它搜索出一对引物我按着这个序列去primer里找发现不在那个位置,比如今天找一个在Oligo里是在199那里,到primer里却是第79个碱基
3楼2011-03-30 16:53:30
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65900931

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我喜欢用NCBI的primer-blast,很方便。设计完再用oligo看看是否通过。
4楼2011-03-30 18:21:08
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love_st

金虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 7788945 at 2011-03-30 16:53:30:
功能是强大,但是显着有点乱,很多详细参数没默认显示出来,还有一点可能是我没操作对,就是它搜索出一对引物我按着这个序列去primer里找发现不在那个位置,比如今天找一个在Oligo里是在199那里,到primer里却是 ...

位置,一个是算起始,一个是算终点,所以有差别,习惯了就很好
5楼2011-03-31 17:24:19
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新东方之剑

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 65900931 at 2011-03-30 18:21:08
我喜欢用NCBI的primer-blast,很方便。设计完再用oligo看看是否通过。

我也是这样做的,支持下!
新东方之剑
6楼2014-09-08 01:32:53
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