| 查看: 1980 | 回复: 5 | |||
[交流]
【求助/交流】基因序列的分析 已有5人参与
|
|
我克隆了一个基因的cDNA 全长怎样才能知道以下这些信息？ 以下是某个基因的信息，是个例子： 推测该基因包括1 638 bp的开放读码框( Open read ing frame, ORF) , 42 个碱基的5非翻译区( 5un translated reg ion, 5UTR) , 365个碱基的3非翻译区 ( 3untranslated reg ion, 3UTR) , 编码1个545个氨 基酸的多肽, 推测的分子量为60 400 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有133人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽~~
已经有11人回复
- online fasta sequence toolbox 基因序列分析处理网站 FaBox (1.35)
已经有8人回复
- 蛋白氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定
已经有33人回复
- DNA条形码能用来分析种内的遗传变异、遗传多样性吗？
已经有11人回复
- 请问仅仅克隆到两个花生基因全长并做了序列分析，国内杂志能投哪里？
已经有3人回复
- 【求助/交流】举例说明模式生物中一个基因的序列的获取、序列分析和功能分析
已经有8人回复
- 【原创】利用网络资源进行序列数据分析一条龙方法
已经有12人回复
- 【求助/交流】基因序列的分析
已经有4人回复
- 【求助/交流】基因测序结果分析问题
已经有9人回复
- 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列
已经有17人回复
ls2046
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 52 (初中生)
- 金币: 25640.8
- 散金: 150
- 红花: 8
- 帖子: 3054
- 在线: 120小时
- 虫号: 350727
- 注册: 2007-04-21
- 性别: GG
- 专业: 微生物遗传育种学
2楼2011-03-29 19:11:01
65900931
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 273.5
- 帖子: 85
- 在线: 18.5小时
- 虫号: 583821
- 注册: 2008-08-01
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2011-03-29 20:38:04
csdyg
木虫 (正式写手)
- MolEPI: 4
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 3737.5
- 散金: 277
- 红花: 9
- 帖子: 422
- 在线: 529.6小时
- 虫号: 94520
- 注册: 2005-09-27
- 专业: 生物大分子结构与功能
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+8): 热心鼓励 2011-03-30 08:15:01
dhd997(金币+8): 热心鼓励 2011-03-30 08:15:01
|
楼主一帖两发，我也跟你一帖两回。 楼主说的问题其实应该就是ORF Find和氨基酸序列分析。首先如果你拿到的是cDNA序列，你可以直接用NCBI的ORF Finder对你的序列进行分析，找到正确的读码框。 ORF Finder： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 当然另外还有很多离线软件可以做这个工作，不过你要的序列分析也不是很复杂，ORF Finder完全可以了。 找到正确读码框后，一般说来cDNA的正确读码框上第一个ATG也就是编码第一个Methionine的这个三联密码子就是你的起始密码子，在这之前的序列就是5’非翻译区，英文叫5' untranslate region (5' UTR, 相信你听过这个概念) ，然后你找到你的正确读码框的第一个终止密码子（UAA, UGA or UAG，在你的cDNA序列上应该显示TAA, TGA 或者TAG），这之后的序列是3‘非翻译区。 至于蛋白序列的分析，你找到正确读码框之后，把这个正确读码框编码的氨基酸序列在网上随便找一个氨基酸序列分析在线软件，输入进去就可以得到预测的分子量了。 给你推荐一个：http://www.bioinformatics.org/sms/ 上面这个网址进去，左面是工具列表，基础的生物信息学分析都能做了，包括ORF Finding和5'UTR, 3'UTR分析，包括蛋白质分子量预测，还有其他功能相信你也能用到。只是这个在线工具比较不人性化，没有那么多复杂的显示功能，如果你有生物信息学基础那用起来就方便的多。 需要注意的是，所有预测得到的ORF，3'UTR, 5'UTR等等都是软件预测结果，如果你要精确，还需要实验验证，最好就是3‘RACE 和 5’RACE。 希望能帮上你。 |
4楼2011-03-30 04:38:41
wleileiyu555
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 242
- 帖子: 26
- 在线: 27.7小时
- 虫号: 1138954
- 注册: 2010-11-04
- 专业: 生物大分子结构与功能
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
|
用NCBI上的ORF finder就行：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 蛋白分子量，等电点之类的就用ProtParam：http://au.expasy.org/tools/protparam.html |
5楼2011-03-30 13:12:08
6楼2012-12-21 16:40:19
