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【求助】势能面最后数据提取
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shenhai1315
木虫
(正式写手)
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虫号: 751211
[交流]
【求助】势能面最后数据提取
大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提取好多个能量和扫描的二面角.现在麻烦大家有这方面经验的帮下忙, 看如何提取这些数据或者有软件的话也麻烦给我一份,非常感谢.
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1楼
2011-03-29 17:41:44
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小鱼儿2008
木虫
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
好像只能手动提取
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4楼
2011-04-22 15:40:03
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xj544
木虫
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖
zhou2009(金币+3): 2011-04-20 15:48:37
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Originally posted by
shenhai1315
at 2011-03-29 17:41:44:
大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提 ...
提取能量和二面角,可以在输出文件中ctrl+F,查找,查找出关键字,逐个提取。
其实能量可以在打开的scan图中,右击,save data,纵坐标就是能量。二面角就无能为力了,逐个提取吧
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2楼
2011-04-20 15:27:11
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wanghanlu
银虫
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二面角是自己设的固定参数,不要提取吧。
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3楼
2011-04-22 10:44:10
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suosuosky
铁杆木虫
(著名写手)
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帖子: 1986
在线: 196.8小时
虫号: 962135
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by
shenhai1315
at 2011-03-29 17:41:44:
大家好:
我最近学习做一个分子的势能面扫描,但是我发现用刚性扫描scan的话,最后列出来了二面角和能量值.但是如果用柔性opt=modredun 扫描的话最后列出来的是每一个扫描点的所有结构参数,这样我扫描100个点,我要提 ...
我也想问同一个问题,你现在知道怎样提取了吗?
请问在搜索输出文件的时候,使用什么关键词来搜索到能量值吗?
谢谢!
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5楼
2011-05-26 09:18:04
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